A1CF

A1CF
Cấu trúc được biết đến PDB Tìm trên Human UniProt: PDBe RCSB Danh sách mã id PDB 2CPD
Mã định danh
Danh pháp	A1CF, ACF, ACF64, ACF65, APOBEC1CF, ASP, APOBEC1 complementation factor
ID ngoài	OMIM: 618199 HomoloGene: 16363 GeneCards: A1CF
Vị trí gen (Người) NST Nhiễm sắc thể 10 (người)[1] Băng 10q11.23 Bắt đầu 50,799,409 bp[1] Kết thúc 50,885,675 bp[1]
Mẫu hình biểu hiện RNA Thêm nguồn tham khảo về sự biểu hiện
Bản thể gen Chức năng phân tử • nucleic acid binding • double-stranded RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • single-stranded RNA binding • RNA binding • mRNA binding Thành phần tế bào • tế bào chất • apolipoprotein B mRNA editing enzyme complex • Mạng lưới nội chất • nhân tế bào • Chất nhân Quá trình sinh học • mRNA processing • protein stabilization • cytidine to uridine editing • mRNA modification • mRNA localization resulting in posttranscriptional regulation of gene expression Nguồn: Amigo / QuickGO
Gen cùng nguồn
Loài	Người	Chuột
Entrez	29974	n/a
Ensembl	ENSG00000148584	n/a
UniProt	Q9NQ94	n/a
RefSeq (mRNA)	NM_001198818 NM_001198819 NM_001198820 NM_014576 NM_138932 NM_138933 NM_001370130 NM_001370131	n/a
RefSeq (protein)	NP_001185747 NP_001185748 NP_001185749 NP_055391 NP_620310 NP_620311 NP_001357059 NP_001357060	n/a
Vị trí gen (UCSC)	Chr 10: 50.8 – 50.89 Mb	n/a
PubMed	[2]	n/a
Wikidata
Xem/Sửa Người

Yếu tố bổ sung APOBEC1 là một protein mà ở người được mã hóa bởi gen A1CF.^[3][4][5]

Gen

Sự ghép nối thay thế xảy ra tại quỹ tích này và ba biến thể phiên mã độ dài đầy đủ, mã hóa ba dạng đồng phân riêng biệt, đã được mô tả. Mối nối bổ sung đã được quan sát nhưng bản chất đầy đủ của các biến thể này vẫn chưa được xác định.^[5]

Chức năng

mARN Apolipoprotein B của động vật có vú trải qua quá trình khử từ C đến U đặc hiệu tại chỗ, được trung gian bởi một phức hợp enzyme đa thành phần có chứa một lõi tối thiểu bao gồm APOBEC1 và một yếu tố bổ sung được mã hóa bởi gen này.^[6] Sản phẩm gen có ba mô-đun nhận dạng ARN không giống nhau và thuộc họ protein gắn ARN hnRNP R. Nó đã được đề xuất rằng yếu tố bổ sung này hoạt động như một tiểu đơn vị gắn ARN và kết nối APOBEC1 để khử cytidine ngược dòng. Các nghiên cứu cho thấy protein này cũng có thể liên quan đến các sự kiện chỉnh sửa ARN hoặc xử lý ARN khác.^[5]

Nó thiếu hụt kết quả gây chết ở chuột.^[7]

Tương tác

A1CF đã được hiển thị để tương tác với APOBEC1,^[8] CUGBP2,^[9] và SYNCRIP.^[10][11]

Tham khảo

1. ^ GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000148584 - Ensembl, May 2017
2. “Human PubMed Reference:”.
3. Dance GS, Sowden MP, Cartegni L, Cooper E, Krainer AR, Smith HC (tháng 4 năm 2002). “Two proteins essential for apolipoprotein B mRNA editing are expressed from a single gene through alternative splicing”. J. Biol. Chem. 277 (15): 12703–9. doi:10.1074/jbc.M111337200. PMID 11815617.
4. Chester A, Scott J, Anant S, Navaratnam N (tháng 12 năm 2000). “RNA editing: cytidine to uridine conversion in apolipoprotein B mRNA”. Biochim. Biophys. Acta. 1494 (1–2): 1–13. doi:10.1016/S0167-4781(00)00219-0. PMID 11072063.
5. ^ “Entrez Gene: A1CF APOBEC1 complementation factor”.
6. Henderson JO, Blanc V, Davidson NO (tháng 11 năm 2001). “Isolation, characterization and developmental regulation of the human apobec-1 complementation factor (ACF) gene”. Biochim. Biophys. Acta. 1522 (1): 22–30. doi:10.1016/S0167-4781(01)00295-0. PMID 11718896.
7. Blanc V, Henderson JO, Newberry EP, Kennedy S, Luo J, Davidson NO (tháng 8 năm 2005). “Targeted deletion of the murine apobec-1 complementation factor (acf) gene results in embryonic lethality”. Mol. Cell. Biol. 25 (16): 7260–9. doi:10.1128/MCB.25.16.7260-7269.2005. PMC 1190267. PMID 16055734.
8. Mehta A, Kinter MT, Sherman NE, Driscoll DM (tháng 3 năm 2000). “Molecular cloning of apobec-1 complementation factor, a novel RNA-binding protein involved in the editing of apolipoprotein B mRNA”. Mol. Cell. Biol. 20 (5): 1846–54. doi:10.1128/MCB.20.5.1846-1854.2000. PMC 85365. PMID 10669759.
9. Anant S, Henderson JO, Mukhopadhyay D, Navaratnam N, Kennedy S, Min J, Davidson NO (tháng 12 năm 2001). “Novel role for RNA-binding protein CUGBP2 in mammalian RNA editing. CUGBP2 modulates C to U editing of apolipoprotein B mRNA by interacting with apobec-1 and ACF, the apobec-1 complementation factor”. J. Biol. Chem. 276 (50): 47338–51. doi:10.1074/jbc.M104911200. PMID 11577082.
10. Lau PP, Chang BH, Chan L (tháng 4 năm 2001). “Two-hybrid cloning identifies an RNA-binding protein, GRY-RBP, as a component of apobec-1 editosome”. Biochem. Biophys. Res. Commun. 282 (4): 977–83. doi:10.1006/bbrc.2001.4679. PMID 11352648.
11. Blanc V, Navaratnam N, Henderson JO, Anant S, Kennedy S, Jarmuz A, Scott J, Davidson NO (tháng 3 năm 2001). “Identification of GRY-RBP as an apolipoprotein B RNA-binding protein that interacts with both apobec-1 and apobec-1 complementation factor to modulate C to U editing”. J. Biol. Chem. 276 (13): 10272–83. doi:10.1074/jbc.M006435200. PMID 11134005.

Liên kết ngoài

• Vị trí bộ gen A1CF ở người và thông tin chi tiết về gen A1CF có sẵn trên UCSC Genome Browser.

Đọc thêm