T-kutija

T-kutija
Kristalografska struktura TBX3 proteinskog dimera (cijan i zelena) u kompleksu sa DNK (smeđa) na osnovu 1h6f koordinata.
Identifikatori
SimbolT-box
PfamPF00907
InterProIPR001699
PROSITEPS50252
SCOP21xbr / SCOPe / SUPFAM
Dostupne proteinske strukture:
Pfam  strukture / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumsažetak strukture
PDB1h6f, 1xbr

T-kutija se odnosi na grupu transkripcijskih faktora uključenih u embrionski razvoj udova i srca.[1] Svaki protein T-kutije ima relativno veliki domen koji se vezuje za DNK, općenito čineći oko trećine cijelog proteina koji je neophodan i dovoljan za vezanje DNK, specifično za sekvencu. Svi članovi porodice gena T-boksa vezuju se za "T-kutijjsku", DNK konsenzusnu sekvencu TCACACCT.[2]

Članovi

[uredi | uredi izvor]

T-kutije su posebno važne za razvoj embriona, a pronađene u oocitima zebrica (Bruce et al 2003 i Xenopus laevis jajne ćelije, Xanthos et al 2001). One su također eksprimirane u kasnijim fazama, uključujući odrasle miševe i kuniće koje su proučavali Szabo et al 2000.[3]

Mutacije ,u prvoj pronađenoj od njih, uzrokovale su kratke repove kod miševa, pa je protein kodiran nazivom brahiurija, grčki za "kratki rep". Kod miševa ovaj gen je nazvan "T", ali kod ljudi se zove "TBXT".[4][5] Brahiurija pronađen je kod svih bilateralnih životinja koje su pregledane, a prisutan je i u Cnidaria.[6]

Mišji "T" gen je kloniran,[7] i dokazano je da je brahiurikjsko embrionsko jezgo od 436 aminokiselina transkripcijski faktor. Brahiurija vezuje se za T-kutiju, preko regije na njegovom N-kraju.

Proteinska aktivnost

[uredi | uredi izvor]

Kodirani proteini Tbx5 i Tbx4 imaju ulogu u razvoju udova i glavnu ulogu posebno u inicijaciji pupoljka udova.[8] Naprimjer, kod kokoši Tbx4 specificira status zadnjih ekstremiteta, dok Tbx5 specificira status prednjih.[9] Aktivacija ovih proteina pomoću Hox gena pokreće signalne kaskade koje uključuju Wnt signalni put i FGF signale u pupoljcima ekstremiteta..[8] Konačno, Tbx4 i Tbx5 dovode do razvoja apikalnog ektodermnog grebena (AER) i centri signalizacije zone polarizirajuće aktivnosti (ZPA) u pupoljku ekstremiteta u razvoju, koji određuju orijentacijski rast udova u razvoju.[8] Zajedno, Tbx5 i Tbx4 imaju ulogu u oblikovanju mehkih tkiva (mišića i tetiva) mišićno-koštanog sistema.[10]

Defekti

[uredi | uredi izvor]

Kod ljudi i nekih drugih životinja, defekti u ekspresiji gena TBX5 odgovorni su za Holt-Oramov sindrom, koji je karakteriziran najmanje jednim abnormalnim šakinog zgloba. Ostale kosti ruke su gotovo uvijek zahvaćene, iako težina može uveliko varirati, od potpunog odsustva kosti, do samo smanjenja njene dužine.[11][12] Oko 75% voboljelih osoba također ima defekt srčanokomorske pregrade, pri čemu najčešće ne postoji razdvajanje između lijeve i desne srčane komore.[13]

TBX3 povezan je sa ulnarno-mamilskim sindromom kod ljudi, ali je također odgovoran za prisustvo ili odsustvo sivosmeđe dlake kod konja, i nema štetne efekte bez obzira da li je eksprimiran ili ne.[14]

T-kutijski geni

[uredi | uredi izvor]

Geni koji kodiraju T-kutijske proteine uključuju:

Također pogledajte

[uredi | uredi izvor]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ Wilson V, Conlon FL (2002). "The T-box family". Genome Biology. 3 (6): REVIEWS3008. doi:10.1186/gb-2002-3-6-reviews3008. PMC 139375. PMID 12093383.
  2. ^ Müller, CW; Herrmann, BG (23. 10. 1997). "Crystallographic structure of the T domain-DNA complex of the Brachyury transcription factor". Nature (jezik: engleski). 389 (6653): 884–8. Bibcode:1997Natur.389..884M. doi:10.1038/39929. PMID 9349824. S2CID 13138577.
  3. ^ Naiche, L.A.; Harrelson, Zachary; Kelly, Robert G.; Papaioannou, Virginia E. (1. 12. 2005). "T-Box Genes in Vertebrate Development". Annual Review of Genetics. Annual Reviews. 39 (1): 219–239. doi:10.1146/annurev.genet.39.073003.105925. ISSN 0066-4197.
  4. ^ "Entrez Gene: T".
  5. ^ Edwards YH, Putt W, Lekoape KM, Stott D, Fox M, Hopkinson DA, Sowden J (mart 1996). "The human homolog T of the mouse T(Brachyury) gene; gene structure, cDNA sequence, and assignment to chromosome 6q27". Genome Research. 6 (3): 226–33. doi:10.1101/gr.6.3.226. PMID 8963900.
  6. ^ Scholz CB, Technau U (januar 2003). "The ancestral role of Brachyury: expression of NemBra1 in the basal cnidarian Nematostella vectensis (Anthozoa)". Development Genes and Evolution. 212 (12): 563–70. doi:10.1007/s00427-002-0272-x. PMID 12536320. S2CID 25311702.
  7. ^ Herrmann BG, Labeit S, Poustka A, King TR, Lehrach H (februar 1990). "Cloning of the T gene required in mesoderm formation in the mouse". Nature. 343 (6259): 617–22. Bibcode:1990Natur.343..617H. doi:10.1038/343617a0. PMID 2154694. S2CID 4365020.
  8. ^ a b c Tickle C (oktobar 2015). "How the embryo makes a limb: determination, polarity and identity". Journal of Anatomy. 227 (4): 418–30. doi:10.1111/joa.12361. PMC 4580101. PMID 26249743.
  9. ^ Rodriguez-Esteban C, Tsukui T, Yonei S, Magallon J, Tamura K, Izpisua Belmonte JC (april 1999). "The T-box genes Tbx4 and Tbx5 regulate limb outgrowth and identity". Nature. 398 (6730): 814–8. Bibcode:1999Natur.398..814R. doi:10.1038/19769. PMID 10235264. S2CID 4330287.
  10. ^ Hasson P, DeLaurier A, Bennett M, Grigorieva E, Naiche LA, Papaioannou VE, Mohun TJ, Logan MP (januar 2010). "Tbx4 and tbx5 acting in connective tissue are required for limb muscle and tendon patterning". Developmental Cell. 18 (1): 148–56. doi:10.1016/j.devcel.2009.11.013. PMC 3034643. PMID 20152185.
  11. ^ "Holt-Oram syndrome". Genetics Home Reference. U.S. National Library of Medicine. juni 2014. Pristupljeno 18. 4. 2018.
  12. ^ McDermott DA, Fong JC, Basson CT. Holt-Oram Syndrome. 2004 Jul 20 [Updated 2015 Oct 8]. In Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA, et al., editors. GeneReviews® [Internet]. Seattle (WA): University of Washington, Seattle; 1993-2018. Available from: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1111/
  13. ^ Bossert, T; Walther, T; Gummert, J; Hubald, R; Kostelka, M; Mohr, FW (oktobar 2002). "Cardiac malformations associated with the Holt-Oram syndrome—report on a family and review of the literature". The Thoracic and Cardiovascular Surgeon. 50 (5): 312–4. doi:10.1055/s-2002-34573. PMID 12375192.
  14. ^ Imsland F, McGowan K, Rubin CJ, Henegar C, Sundström E, Berglund J, et al. (februar 2016). "Regulatory mutations in TBX3 disrupt asymmetric hair pigmentation that underlies Dun camouflage color in horses". Nature Genetics. 48 (2): 152–8. doi:10.1038/ng.3475. PMC 4731265. PMID 26691985. Sažetak – Science Daily.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linksovi

[uredi | uredi izvor]