Isabelle Faust va rebre les primeres lliçons de violí a l'edat de cinc anys.[4] Ha tingut com a professors Christoph Poppen i Dénes Zsigmondy. A l'edat d'onze anys va fundar un quartet de corda i sempre s'ha sentit atreta per compartir experiències i visions musicals a través de la disciplina de la música de cambra. Tant interpretant sonates com concerts, Faust busca el diàleg i l'intercanvi d'idees musicals.[5]
Va rebre el 1987 un premi en el Concurs Leopold Mozart a Augsburg i va guanyar el concurs Paganini a Gènova el 1993.[6] Després d'això es va traslladar a França, on es va especialitzar en el repertori francès, especialment en Fauré i Debussy.
El seu primer enregistrament van ser les sonates de Bartók, Szymanowski i Janácek, i va obtenir molt bona recepció crítica. El 2003 va llançar el seu enregistrament del Concert per a violí de Dvorák, que és una especialitat del seu repertori. El 2007 va publicar el Concert de violí de Beethoven, fent-ne una versió poc habitual que busca recrear l'esperit de l'època en què va ser compost.
Toca sovint música de cambra amb els pianistes Alexander Melnikov i Ewa Kupiec, amb el violoncel·lista Jean-Guihen Queyras o amb la clarinetista Sharon Kam. Amb Melnikov, el seu partenaire habitual, va gravar la integral de les Sonates per a violí i piano de Beethoven, que va rebre els premis "Gramophone", “Choc de Classic”, "Diapason d'Or", “ECHO Klassik” i el “Premi de la Crítica Alemanya” i s'ha convertit en una referència discogràfica d'aquest repertori.[7] A més va ser nominada als Premi Grammy en 2010.
En 2004 va ser nomenada professora de violí de l'Acadèmia de les Arts de Berlín. Fou artista resident a la Filharmònica de Colònia durant la temporada 2018/2019.[7] La temporada 2019-2020 Isabelle Faust ha estat nomenada artista resident del Centro Nacional de Difusión Musical (CNDM).[8][3]
Des del començament, grava sota el segell Harmonia Mundi. Toca un Stradivarius de 1704 sobrenomenat "La Bella Dorment del Bosc" posat a la seva disposició pel L-Bank de Baden-Württemberg; sembla que és dels pocs Stradivarius que conserven el mànec (pal) original.[9] Els compositors Thomas Larcher i Michael Jarrell li han dedicat obres.[2]
1987: Leopold Mozart International Violin Competition, (Augsburg), Primer Premi
1990: Premi Quadrivio Competition (Rovigo, Itàlia), Primer Premi
1993: Paganini Competition a Gènova, Itàlia, Primer Premi[6]
1994: Förderpreis des Landes Nordrhein-Westfalen für junge Künstlerinnen und Künstler
1997: Premis Gramophone a "Young Artist of the Year" pel seu primer CD, The només violin sonata and the Violin Sonata No. 1 de Béla Bartók en Harmonia Mundi
2002: Cannes Classical Award pel seu disc per a ECM del Concert Fúnebre de Karl Amadeus Hartmann.
2010: Diapason d'Or de l’Année pel seu disc de les Sonates i Partitas per a violí sol de Johann Sebastian Bach en Harmonia mundi[10]
2012: Gramophone Award com Best Chamber Recording per al seu àlbum de les Sonates de violí de Ludwig van Beethoven amb el pianista Alexander Melnikov for Harmonia Mundi[11]
2012: Tiro Klassik Award per al seu àlbum de les Sonates de violí de Ludwig van Beethoven amb el pianista Alexander Melnikov
2012: Diapason d'Or per al seu àlbum de les Sonates de violí de Ludwig van Beethoven amb el pianista Alexander Melnikov