Lilien se zúčastnil pátého sionistického kongresu, který se konal v Basileji, jako člen Demokratické frakce, opoziční skupiny, která podporovala rozvoj sekulární národní kultury. V roce 1905 se na sedmém sionistickém kongresu v Basileji spolu s Borisem Schatzem stal členem výboru zřízeného za účelem zřízení Bezalelské umělecké školy.[1] V rámci této práce doprovázel Schatze do Jeruzaléma.
Lilien byl jedním ze dvou umělců, kteří v roce 1906 doprovázeli Borise Schatze na území dnešního Izraele za účelem založení Becalelovy akademie umění a designu a v roce 1906 učil první ročník školy. Ačkoli jeho pobyt v zemi trval jen krátce, zanechal svou nesmazatelnou stopu po vytvoření stylu Eretz Israel, který biblické předměty umístil do sionistického kontextu a orientálního prostředí, koncipovaného v idealizovaném západním designu. V prvních dvou desetiletích století sloužila Lilienova práce pro skupinu Bezalel jako model.
Lilien je známý svým fotografickým portrétem Theodora Herzla. Často Herzla využíval jako model, protože jeho rysy považoval za dokonalou reprezentaci „nového Žida“.[2] V roce 1896 obdržel cenu za fotografii od avantgardního časopisu Jugend. Lilien ilustroval několik knih. V roce 1923 byla v New Yorku zahájena výstava jeho prací.
Mezi knihy, které autor ilustroval, patří Juda (1900), poezie s biblickými tématy od jeho křesťanského přítele Börries Freiherra von Münchhausena a Lieder des Ghetto (Písně ghetta, 1903), jidiš básně Morrise Rosenfelda přeložené do němčiny.
Lilien zemřel v Badenweiler v Německu v roce 1925. Je po něm pojmenována ulice v jeruzalémské čtvrti Najot.
Reinhard Bein: Sie lebten in Braunschweig. Biografische Notizen zu den in Braunschweig bestatteten Juden (1797 bis 1983). In: Mitteilungen aus dem Stadtarchiv Braunschweig. Nr. 1, Döring Druck, Braunschweig 2009, ISBN 978-3-925268-30-4.
Reinhard Bein: Zeitzeugen aus Stein. Svazek 2. Braunschweig und seine Juden. Braunschweig 1996, ISBN 3-925268-18-9, s. 97 ff.
Bert Bilzer, Richard Moderhack (vyd.): BRUNSVICENSIA JUDAICA. Gedenkbuch für die jüdischen Mitbürger der Stadt Braunschweig 1933–1945. In: Braunschweiger Werkstücke, Svazek 35. Braunschweig 1966.
Lothar Brieger: E. M. Lilien – Eine künstlerische Entwicklung um die Jahrhundertwende. Verlag Benjamin Harz, Berlín 1922
Haim Finkelstein: E. M. Lilien in the Middle East, Etchings (1908–25). Ben Gurion University, 1988.
Mark H. Gelber: E. M. Lilien und die jüdische Renaissance. In: Bulletin des Leo Baeck Instituts, 87 (1990), 45–53.
Alfred Gold: E. M. Lilien. In: Martin Buber (vyd.): Jüdische Künstler. Jüdischer Verlag, Berlín 1903, s. 73–104 (judaica-frankfurt.de).
Lionel Gossman: Jugendstil in Firestone: The Jewish Illustrator E. M. Lilien (1874–1925). In: Princeton University Library Chronicle, Volume LXVI, Number 1, Autumn 2004, s. 11–78.
Dirk Heißerer: Der Radierer und Lichtzeichner Ephraim Moses Lilien (1874–1925). Galerie Michael Hasenclever, München 2004.
Ekkehard Hieronimus: Der Grafiker E. M. Lilien (1874–1925). In: Arbeitsberichte aus dem Städtischen Museum Braunschweig. Heft 25. Städtisches Museum Braunschweig, Braunschweig 1974.
M. S. Levussove: The New Art of An Ancient People: The Work of Ephraim Mose Lilien. B. W. Huebsch, New York 1906
E. M. Lilien: Briefe an Seine Frau 1905–1925. vyd. Otto M. Lilien / Eve Strauss. Jüdischer Verlag Athenaeum, Königstein/Ts. 1985.
Regine Nahrwold: Lilien, Ephraim Moses. In: ISBN 3775258388, s. 383f
N. N.: E. M. Lilien. Sein Werk. Mit einer Einleitung von Stefan Zweig. Schuster & Loeffler, Berlín/Leipzig 1903.
Michael Stanislawski: From Jugendstil to ‘Judenstil’: Cosmopolitanism and Nationalism in the Work of Ephraim Moshe Lilien. In: Ders.: Zionism and the Fin-de-Siècle: Cosmopolitanism and Nationalism from Nordau to Jabotinsky. University of California Press, Berkeley 2001, s. 98–115.
Claus Stephani: Das Bild des Juden in der modernen Malerei. Eine Einführung. / Imaginea evreului în pictura modernă. Studiu introductiv. Dvojjazyčné vydání (rumunsky / německy). Editura Hasefer, Bukurešť 2005, ISBN 973-630-091-9.