Stizenberger studierte ab 1844 Medizin und Naturwissenschaften in Freiburg (wo er bei Alexander Braun Botanik und bei Karl Fromherz Geologie und Mineralogie studierte) mit der Promotion in Medizin 1850 mit einer paläontologischen Dissertation (Übersicht über die Versteinerungen des Großherzogtums Baden). 1848/49 studierte er auch in Zürich.[1] Danach setzte er sein Studium in Wien und Prag fort, bevor er sich nach erfolgter Staatsprüfung (1851) als Arzt in seiner Heimatstadt Konstanz niederließ. Er war auch langjähriger leitender Arzt des Stadtspitals, zweiter Gerichtsarzt und ab 1852 Visitator der Apotheken.
Als Botaniker befasste er sich mit Flechten und Algen. Er bearbeitete zum Beispiel die Flechten der Novara-Expedition und die Flechten-Sammlung von Robert Reuleaux in Nordamerika.
Neben Botanik befasste er sich leidenschaftlich mit Musik (er spielte Harmonium) und schrieb eine Musikgeschichte Badens. Stizenberger war Führer der badischen Volkspartei.[3] Er war auswärtiges Mitglied der St. Gallischen Naturwissenschaftlichen Gesellschaft, in deren Jahresberichten er viel veröffentlichte, und korrespondierendes Mitglied der Naturforschenden Gesellschaft Zürich.
Uebersicht der Versteinerungen des Grossherzogthums Baden. J. Diernfellner, Freiburg i./B. 1851 Google Books
Ueber die zu Heilzweken dienenden Injections- und Saugapparate und deren Anwendung für Aerzte und Studirende. Ebner & Seubert, Stuttgart 1856 Archive
Dr. Ludwig Rabenhorst's Algen Sachsens, resp. Mitteleuropas, Decade I–C, systematisch geordnet (unter Zugrundelegung eines neuen Systems). C. Heinrich, Dresden 1860 Google Books
Beitrag zur Flechtensystematik, Jahresbericht der St. Galler Naturforschenden Gesellschaft 1861/62
Ueber den gegenwärtigen Stand der Flechtenkunde, in: Flora, 1861
Kritische Bemerkungen über die Lecideaceen mit nadelförmigen Sporen. E. Blochmann & Sohn, Dresden 1863 Google Books
Lecidea sabuletorum Flörke und die ihr verwandten Flechten-Arten. E. Blochmann & Sohn, Dresden 1867 Google Books
Rosenthals Forschungsexpedition nach Nowaja Semlja. Verzeichnis der von Th. von Heugel hiebei gesammelten Flechten.Petermanns Geographische Mitteilungen 1872
Botanische Plaudereien über die Flechten (Lichenes), Glarus 1873
Kriegsbereitschaft im Reiche Floras. Jahresbericht der St. Galler Naturf. Ges., 1873/74
Index lichenum hyperboreorum. Jahresbericht der St. Galler Naturf. Ges., 1874/75
Die ökonomischen Beziehungen der Flechten. Jahresbericht der St. Galler Naturf. Ges., 1877/78
Lichenes Helvetici. Jahresbericht der St. Galler Naturf. Ges., 1880/81, 1881/82
Grundlinien einer Geschichte der Tonkunst im Lande Baden. 1883
Lichenes Insulae Maderae. Extr. do Boletim da Soc. Brot., 1887
Lichenaea Africana. Jahresbericht der St. Galler Naturf. Ges., 1888/89, Supplementa 1891/92, Addenda und Corrigenda 1893/94
Die Grübchenflechten, Strictei und ihre geographische Verbreitung. in: Flora, 1895, Ergänzungsband
Karl Fromherz: Handbuch der Geologie. E. Schweizerbart’sche Verlagshandlung und Druckerei, Stuttgart 1856 (posthum herausgegeben von Ernst Stizenberger) Archive