Chamene’i ist ein jüngerer Bruder von Ali Chamene’i, mit dem er sich entzweite.[4][5] Am 11. Februar 1999 griff ihn ein konservativer Mob aus etwa hundert Personen in Qom an, und er erlitt einen Schädelbruch.[6][7] Zahlreiche Zeitschriften setzten sich danach für ihn ein.[8]
Chamene’i ist als Publizist regimekritischer Zeitschriften, besonders Hayat-e No, bekannt.[9] Seine Zeitschrift Jahan-e Islam wurde 1995 wegen „Beleidigung des Islam“ und „Verbreitung von Falschinformation“ eingestellt.[4][10][2][11]