Ergüner erlernte das Nayspiel bei seinem Vater Ulvi Ergüner und seinem Großvater Suleyman Ergüner, die beide bedeutende Meister auf dem Flöteninstrument waren. Er wurde von Kontakten mit dem Sufi-Orden der Mevlevi geprägt.
1969 wurde er Mitglied des Rundfunkorchester von Istanbul; 1975 ging er nach Paris, wo er Architektur und Musikwissenschaft studierte. Im Folgejahr arbeitete er bei den Dreharbeiten für Peter Brooks Film Meetings With Remarkable Men in Afghanistan mit. Später war er auch Komponist und ausführender Musiker bei Brooks Theaterstück und Film Mahabharata.
Nach einer Studienreise im Auftrag der UNESCO durch die Türkei 1980 gründete er in Paris das Institut Mevlani, an dem klassische Musik und die Lehren der Sufi gelehrt werden. 1986 und 1987 unternahm er ausgedehnte Reisen durch Afghanistan, um traditionelle Musik aufzunehmen und zu dokumentieren. Ende 1987 gab er ein Konzert mit Musik des osmanischen Hofes in der Royal Albert Hall in London. 1988 gründete er die Gruppe Fasi, aus der später das Kudsi Ergüner Ensemble hervorging.
↑Peter Gabriel Ltd.: Passion - Music for The Last Temptation Of Christ a film by Martin Scorsese. CD-Booklet. Hrsg.: Real World Records. Box, Wiltshire 5. Juni 1989 (britisches Englisch).
↑Peter Gabriel Ltd.: Passion Sources. CD-Booklet. Hrsg.: Real World Records. Box, Wiltshire 5. Juni 1989 (britisches Englisch).