Im Spanischen Bürgerkrieg kämpfte er auf Seiten der Republikaner (zuletzt als Artilleriehauptmann). Unter der Franco-Diktatur kam er in das KonzentrationslagerSalamanca, verbrachte die Jahre von 1939 bis 1943 im Gefängnis in Madrid und war von 1943 bis 1959 auf Mallorca in der Verbannung. 1947 wurde er in das neu gegründete Instituto Miguel de Cervantes de Filología Hispánica berufen und 1952 als korrespondierendes Mitglied in die Real Academia Española gewählt.
1959 kehrte er nach Valencia zurück und wurde 1960 Professor an der Universität Valencia. 1966 wurde er in die Real Academia de la Historia gewählt. Ab 1979 besetzte er den neu geschaffenen Lehrstuhl für valencianische Linguistik und wurde zum Dekan gewählt.
Nachdem er 1978 einem Bombenattentat (durch rechtsextremistische Kreise) entgangen war, starb er 1981 an einem Herzinfarkt.
Sanchis Guarner gilt als Begründer der modernen Philologie des Valencianischen.
La llengua dels valencians, Valencia 1933, 80 Seiten (zahlreiche Auflagen bis 2009, 394 Seiten)
Introducción a la historia lingüística de Valencia, Valencia 1948 (Vorwort von Ramón Menéndez Pidal)
Gramàtica valenciana, Valencia 1950 (Vorwort von Francesc de Borja Moll); hrsg. von Antoni Ferrando, Barcelona 1993
(Hrsg.) Els poetes romàntics de Mallorca. Recull antològic amb una introducció i comentaris, Palma 1950, 1981
(Hrsg.) Els poetes insulars de postguerra. Antologia aplegada, Palma 1951
Calendari de refranys, Barcelona 1951
La cartografía lingüística en la actualidad y el Atlas de la Península Ibérica, Madrid 1953
(Mitarbeiter mit Anna Moll Marquès) Antoni Maria Alcover, Diccionari català-valencià-balear. Inventari lexicogràfic i etimològic de la llengua catalana en totes les seves formes literàries i dialectals, hrsg. von Francesc de Borja Moll, 10 Bde., Palma 1926–1968, 1978–1979, 1993 (1, 1926, 1964; 2, 1935, 1968; 3-10, 1956–1962)
Els Parlars romànics de València i Mallorca anteriors a la Reconquista, Valencia 1961
Els Valencians i la llengua autòctona durant els segles XVI, XVII i XVIII, Valencia 1963, 2001
Història del País Valencià 1. Època musulmana, Barcelona 1965, 1975, 1988
La Renaixença al país valencià. Estudi per generacions, Barcelona 1968
La ciutat de València. Síntesi d'història i de geografia urbana, Valencia 1972, 1983 (spanisch: Valencia 1999)
Aproximacie a la historia de la lengua catalana. Creixencai esplendor, Barcelona 1980
Els inicis del teatre valencià modern 1845–1874, Valencia 1980
Estudis en memòria del professor Manuel Sanchis Guarner. Estudis de llengua i literatura catalanes, hrsg. von Antoni Ferrando, 2 Bde., Valencia 1984
Miscel.lània Sanchis Guarner, hrsg. von Antoni Ferrando, Montserrat 1992
Manuel Sanchis Guarner, El compromís cívic d'un filòleg, hrsg. von Antoni Ferrando und Francesc Pérez i Moragon, Valencia 1998
Santi Cortés, Manuel Sanchis Guarner, 1911–1981. Una vida per al diàleg, Valencia 2002 (Vorwort von Antoni Ferrando)
Manuel Sanchis Guarner, Lletres de resistència, hrsg. von Santi Cortés, Catarroja 2005
Joan Coromines und Manuel Sanchis Guarner, Epistolari, hrsg. von Josep Ferrer und Joan Pujadas, Barcelona 2006
Manuel Sanchis Guarner. Un humanista valencià del segle XX [Ausstellung], Valencia 2006
Antoni Ferrando i Santi Cortés, Manuel Sanchis Guarner. Context. Paraula. Record, Valencia 2007
Jornades de la Secció Filològica a València i Alcoi. Homenatge a M. Sanchis Guarner amb l'Institut Interuniversitari de Filologia Valenciana. Homenatges a T. Llorente, J. Maragall, M. Sanchis Guarner i E. Valor amb l'Ajuntament d'Alcoi (20 d'octubre de 2011), Barcelona 2013