Sein Werk Biokrieg handelt in einer düsteren Zukunft, in der Rohstoffknappheit, Hungersnot und Genlaboratorien zum Alltag gehören.
Bacigalupis Werke wurden mehrfach ausgezeichnet. Für seinen ersten Roman Biokrieg (The Windup Girl) erhielt er unter anderem den Hugo Award, den Nebula Award und den Compton Crook Award für den besten Debütroman. Das Time Magazine nahm das Werk in die Liste der zehn besten Bücher des Jahres 2009 auf. Die französische Übersetzung La Fille automate erhielt 2013 den Prix Une autre Terre. Der Roman Schiffsdiebe[1] (Ship Breaker) aus dem Jahr 2010 wurde für den National Book Award nominiert. Die zusammen mit Tobias S. Buckell verfasste Sammlung The Tangled Lands wurde 2019 mit dem World Fantasy Award ausgezeichnet.
0000 Locus Award für The Windup Girl in der Kategorie „First Novel“
0000Nebula Award für The Windup Girl als bester Roman
2011 Locus Award für Ship Breaker in der Kategorie „Young Adult Book“
2012 Kurd-Laßwitz-Preis für The Windup Girl in der Kategorie „ausländisches Werk“
0000Premio Ignotus für La chica mecánica in der Kategorie „Mejor novela extranjera“ (bester fremdsprachiger Roman)
0000Seiun Award für The Windup Girl in der Kategorie „Translated Long Form“
2013 Grand Prix de l’Imaginaire für La fille automate (The Windup Girl) in der Kategorie „Roman étranger“
0000 Seiun Award für Pocketful of Dharma in der Kategorie „Translated Short Form“
2015 Grand Prix de l'Imaginaire für La fille-flûte et autres fragments de futurs brisés (Pump Six and Other Stories) in der Kategorie „Nouvelle étrangère“
0000 Premio Ignotus für El jugador in der Kategorie „Mejor cuento extranjero“ (beste fremdsprachige Erzählung)