Seine Eltern waren Victor-Joseph Audouin (1762–1848) und Jeanne-Marie-Pierrette Enée (1774–1837). Sein Vater war im diplomatischen Dienst und die Familie zog häufig um. Er ging zunächst in Reims zur Schule, dann in Paris und auch in Lucca Italien, nach Paris zurückgekehrt besuchte er das Lycée Louis-le-Grand. Audouin begann zunächst Jura zu studieren, wechselte aber aus Interesse an der Naturgeschichte über die Medizin[1] zur Zoologie und wurde 1824 Assistent des Entomologen Pierre André Latreille am Muséum national d’histoire naturelle. 1826 wurde er mit der Schrift Prodrome d’une histoire naturelle, chimique, pharmaceutique et médicale des cantharides an der Fakultät für Medizin der Universität von Parispromoviert. Im Jahre 1833 wurde er Nachfolger Latreilles als Professor für Entomologie. 1838 wurde Audouin Mitglied der Académie des sciences in Paris.
Audouins wichtigstes Werk Histoire des insectes nuisibles à la vigne wurde nach seinem Tode von den Zoologen Henri Milne Edwards und Charles Émile Blanchard 1842 beendet und veröffentlicht. Die meisten seiner Schriften publizierte Audouin in den Annales des sciences naturelles, die er 1824 zusammen mit dem Botaniker Adolphe Théodore Brongniart und dem Chemiker Jean Baptiste Dumas gegründet hatte. Viele Beiträge erschienen auch in den Annales de la Société entomologique de France, die Audouin 1832 mitbegründet hatte.
Audouin heiratete am 6. Dezember 1827 Mathilde-Charlotte Emilie Brongniart (1808–1882), die jüngste Tochter des Chemikers, Geologen und Zoologen Alexandre Brongniart. Das Paar hatte einen Sohn, Paul Audouin (1835–1920), und eine Tochter, Cécile Audouin (1837–1918).
Audouin interessierte sich aber auch für andere naturgeschichtliche Teilgebiete, so war er Koautor des Dictionnaire classique d’histoire naturelle (1822–1830) und studierte zusammen mit Henri Milne Edwards die Meeresfauna in den französischen Küstengebieten. Er vervollständigte auch das ornithologische Kapitel des Naturforschers Marie Jules César le Lorgne de SavignyDescription de l’Égypte (1826).[2]
Im Jahre 1826 gaben er und Henri Milne-Edwards eine Schrift über die Anatomie und Physiologie der marinen Wirbellosen der nordwestlichen Küsten Frankreichs heraus. Sie veröffentlichten 1827 eine Monographie über das Zirkulationssystem von Krebstieren (siehe auch Hämolymphe), Récherches anatomiques et physiologiques sur la circulation dans les crustacés. Im Jahr 1833 wurde er zum ausländischen Mitglied der Königlich Schwedischen Akademie der Wissenschaften gewählt.
Prodrome d’une histoire naturelle, chimique, pharmaceutique, et médicale des cantharides. Paris 1826.
Recherches anatomiques et physiologiques sur la circulation dans les crustacés. In: Annales des sciences naturelles. Band 11, Paris 1827, S. 283–314, S. 352–393.
Résumé d’Entomologie, ou d'histoire naturelle des animaux articulés. 2 Bände, Bachelier, Paris 1828–1829 (Band 1, Band 2).
Recherches pour servir à l'histoire naturelle du littoral de la France. Crochard, Paris 1832–1834 (online).
Histoire naturelle des insectes, traitant de leur organisation et de leurs moeurs en général. Pillot, Paris 1834–1837 (online). - mit Gaspard Auguste Brullé
Jean Baptiste Georges Geneviève Marcellin Bory de Saint-Vincent: Dictionnaire classique d’histoire naturelle. Band3. Rey et Gravier, Raudouin Frères, Paris 1823 (biodiversitylibrary.org).
Adolphe Brogniart: Mémoire sur la famille de Bruniagées. In: Annales des sciences naturelles. Band8, 1827, S.357–389 (biodiversitylibrary.org).
David Gruby: Recherche sur la nature, le siöege et de döveloppement du Porrigo decalvans ou Phytoalopöecie. In: Comptes rendus hebdomadaires des séances de l'Académie des sciences. Band17, 1843, S.301–302 (biodiversitylibrary.org).
Alexandre Louis Lefebvre de Cérisy: Nouveau Groupe d'Orthoptères de la famille de Mantides. In: Annales de la Société entomologique de France. Band4, 1835, S.449–508 (biodiversitylibrary.org).
Henri Milne Edwards: Notice sur la vie et les travaux de Victor Audouin. In: Mémoires d'agriculture, d'économie rurale et domestique. Band2, 1850, S.372–391 (bnf.fr).
Charles Payraudeau: Description de deux espèce nouvelle d oiseaux, appartenant aux genres Mouette et Comoran. In: Annales des sciences naturelles : comprenant La physiologie animale et végétale, l'anatomie comparée des deux règnes, la zoologie, la botanique, la minéralogie et la géologie. Band8, 1826, S.469–465 (biodiversitylibrary.org).
Jean Théodoridès: Un zoologiste de l’époque romantique, Jean-Victor Audouin, 1797–1841. Bibliothèque nationale, Paris 1978, ISBN 2-7177-1443-X.