Halobacteriaceae

Halobacteriaceae
Taxonomía
Dominio:	Archaea
Filo:	Euryarchaeota
Clase:	Haloarchaea Grant et al. 2002
Orden:	Halobacteriales Grant and Larsen 1989
Familia:	Halobacteriaceae Gibbons 1974
Géneros
Haladaptatus Savage et al. 2007 emend. Roh et al. 2010 Halalkalicoccus Xue et al. 2005 Halarchaeum Minegishi et al. 2010 Haloalcalophilium Lizama et al. 2000 Haloarcula Torreblanca et al. 1986 emend. Oren et al. 2009 Halobacterium Elazari-Volcani 1957 emend. Oren et al. 2009 Halobaculum Oren et al. 1995 Halobellus Cui et al. 2011 Halobiforma Hezayen et al. 2002 emend. Oren et al. 2009 Halococcus Schoop 1935 emend. Oren et al. 2009 Haloferax Torreblanca et al. 1986 emend. Oren et al. 2009 Halogeometricum Montalvo-Rodríguez et al. 1998 emend. Cui et al. 2010 Halogranum Cui et al. 2010 emend. Cui et al. 2011 Halolamina Cui et al. 2011 Halomarina Inoue et al. 2011 Halomicrobium Oren et al. 2002 Halonotius Burns et al. 2010 Halopelagius Cui et al. 2010 Halopiger Gutiérrez et al. 2007 Haloplanus Bardavid et al. 2007 emend. Cui et al. 2010 Haloquadratum Burns et al. 2007 Halorhabdus Wainø et al. 2000 emend. Antunes et al. 2008 Halorientalis Cui et al. 2011 Halorubrum McGenity and Grant 1996 emend. Oren et al. 2009 Halorussus ♠ Cui et al. 2010 Halosarcina Savage et al. 2008 emend. Cui et al. 2010 Halosimplex Vreeland et al. 2003 Halostagnicola Castillo et al. 2006 Haloterrigena Ventosa et al. 1999 emend. Oren et al. 2009 Halovivax Castillo et al. 2006 Natrialba Kamekura and Dyall-Smith 1996 emend. Oren et al. 2009 Natrinema McGenity et al. 1998 emend. Xin et al. 2000 Natronoarchaeum Shimane et al. 2010 Natronobacterium Tindall et al. 1984 Natronococcus Tindall et al. 1984 Natronolimnobius Itoh et al. 2005 Natronomonas Kamekura et al. 1997 emend. Burns et al. 2010 Natronorubrum Xu et al. 1999 emend. Oren et al. 2009 Salarchaeum Shimane et al. 2011
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En taxonomía, los Halobacteriaceae son una familia dentro de Halobacteriales en el dominio Archaea.^[1]​

Información general

Halobacteriaceae se encuentra en el agua saturada o casi saturada con sal. También se llaman halófilos, aunque este nombre también se utiliza para otros organismos que viven en agua salada algo menos concentrada. Son comunes en la mayoría de los entornos en los que grandes cantidades de sal, la humedad, y materia orgánica están disponibles. Floraciones grandes aparecen de color rojizo, a partir del pigmento bacteriorodopsina. Este pigmento se utiliza para absorber la luz, que proporciona energía para crear adenosín trifosfato. Halobacterias también poseen un segundo pigmento halorodopsina, que bombea en iones cloruro en respuesta a los fotones, la creación de un gradiente de voltaje y ayudar en la producción de energía de la luz. El proceso no está relacionada con otras formas de fotosíntesis que implica el transporte de electrones. Sin embargo halobacterias son incapaces de fijación de carbono de dióxido de carbono.

Halobacterias puede existir en ambientes salinos, ya pesar de que son aerobios , que tienen una forma separada y diferente de la creación de energía a través del uso de la energía de la luz. Las partes de la membranas de halobacterias son de color púrpura y que contiene pigmentario de la retina. Esto les permite crear un gradiente de protones través de la membrana de la célula que se puede utilizar para crear trifosfato de adenosina.

Vivir dentro de sus ambientes salinos que han hecho ciertas adaptaciones. Su maquinaria celular se adapta a altas concentraciones de sal por haber aminoácidos cargados en las superficies de los cels, que atrae a las moléculas de agua . Ellos usan la presión osmótica y estos aminoácidos para controlar la cantidad de sal dentro de la célula. También hay proteínas dentro de la célula que ayudan a mantenerlo vivo. Sin embargo, a causa de estas adaptaciones, si la celda fuera a ser sacado de su entorno salada natural, lo más probable estallido de la presión osmótica.

Filogenia

La taxonomía aceptado actualmente se basa en la List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)^[2]​ y Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI)^[3]​ y la filogenia se base en 16S rRNA-based LTP versión 106 de 'The All-Species Living Tree' Project.^[4]​

?Haloalcalophilium atacamensis ♠ Lizama et al. 2000     ?Halobaculum gomorrense Oren et al. 1995     ?Halobellus clavatus Cui et al. 2011     ?Halolamina pelagica Cui et al. 2011     ?Halorientalis regularis Cui et al. 2011     ?Halorussus rarus ♠ Cui et al. 2010     ?Salarchaeum japonicum Shimane et al. 2011     Halomarina oriensis Inoue et al. 2011       Natronomonas Kamekura et al. 1997 emend. Burns et al. 2010         ?Halomicrobium zhouii ♣ Yang & Cui 2011         Halomicrobium mukohataei [type sp.] (Ihara et al. 1997) Oren et al. 2002     Halorhabdus Wainø et al. 2000 emend. Antunes et al. 2008         Halarchaeum acidiphilum Minegishi et al. 2010     Halobacterium Elazari-Volcani 1957 emend. Oren et al. 2009           Halosimplex carlsbadense Vreeland et al. 2003       Halomicrobium katesii Kharroub et al. 2008     Haloarcula Torreblanca et al. 1986 emend. Oren et al. 2009               Haladaptatus Savage et al. 2007 emend. Roh et al. 2010         Haloquadratum walsbyi Burns et al. 2007       Halopelagius inordinatus Cui et al. 2010       Halosarcina limi Cui et al. 2010       Halosarcina pallida Savage et al. 2008 [type sp.]     Halogeometricum Montalvo-Rodríguez et al. 1998 emend. Cui et al. 2010               Haloferax Torreblanca et al. 1986 emend. Oren et al. 2009       Halogranum Cui et al. 2010 emend. Cui et al. 2011         Halonotius pteroides Burns et al. 2010     Haloplanus Bardavid et al. 2007 emend. Cui et al. 2010       Halorubrum McGenity and Grant 1996 emend. Oren et al. 2009                   Halalkalicoccus Xue et al. 2005     Halococcus Schoop 1935 emend. Oren et al. 2009         Natronoarchaeum mannanilyticum Shimane et al. 2010       Halovivax Castillo et al. 2006       Halopiger Gutiérrez et al. 2007         Halobiforma Hezayen et al. 2002 emend. Oren et al. 2009       Natronobacterium Tindall et al. 1984     Natronococcus Tindall et al. 1984           Haloterrigena species-group 1 [incl. Halorubrum trapanicum, Natrinema & Natronorubrum sediminis]       Haloterrigena species-group 2       Natronolimnobius Itoh et al. 2005       Natronorubrum Xu et al. 1999 emend. Oren et al. 2009     Natrialba [incl. Halostagnicola]

Notas:
♠ Cepas en el Centro Nacional para la Información Biotecnológica (NCBI) pero no la List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)
♣ International Journal of Systematic Bacteriology o International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB/IJSEM).

Referencias

1. NCBI página en Halobacteriaceae. Los datos extraídos del «NCBI taxonomy resources». National Center for Biotechnology Information. Consultado el 19 de marzo de 2007. 
2. J.P. Euzéby. «Halobacteriaceae». List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Archivado desde el original el 27 de enero de 2013. Consultado el 17 de noviembre de 2011. 
3. Sayers. «Halobacteriaceae». National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Consultado el 5 de junio de 2011. 
4. 'The All-Species Living Tree' Project.«16S rRNA-based LTP release 106 (full tree)». Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Archivado desde el original el 7 de mayo de 2012. Consultado el 17 de noviembre de 2011. 

Otras lecturas

Artículos en revistas científicas

• Wright, A-DG (2006). «Phylogenetic relationships within the order Halobacteriales inferred from 16S rRNA gene sequences». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 56 (Pt 6): 1223-1227. PMID 16738095. doi:10.1099/ijs.0.63776-0. 
• Judicial, Commission of the International Committee on Systematics of Prokaryotes: (2005). «The nomenclatural types of the orders Acholeplasmatales, Halanaerobiales, Halobacteriales, Methanobacteriales, Methanococcales, Methanomicrobiales, Planctomycetales, Prochlorales, Sulfolobales, Thermococcales, Thermoproteales and Verrucomicrobiales are the genera Acholeplasma, Halanaerobium, Halobacterium, Methanobacterium, Methanococcus, Methanomicrobium, Planctomyces, Prochloron, Sulfolobus, Thermococcus, Thermoproteus and Verrucomicrobium, respectively. Opinion 79». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 55 (Pt 1): 517-518. PMID 15653928. doi:10.1099/ijs.0.63548-0. 
• Euzeby JP, Tindall BJ (2001). «Nomenclatural type of orders: corrections necessary according to Rules 15 and 21a of the Bacteriological Code (1990 Revision), and designation of appropriate nomenclatural types of classes and subclasses. Request for an Opinion». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 51 (Pt 2): 725-727. PMID 11321122. 
• Oren A, Ventosa A (2000). «International Committee on Systematic Bacteriology Subcommittee on the taxonomy of Halobacteriaceae. Minutes of the meetings, 16 August 1999, Sydney, Australia». Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50: 1405-1407. PMID 10843089. 

Libros científicos

• Grant WD, Larsen H (1989). «Group III. Extremely halophilic archaeobacteria. Order Halobacteriales ord. nov.». En JT Staley; MP Bryant; N Pfennig et al., eds. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, Volume 3 (1st edición). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. p. 169.  Se sugiere usar |número-editores= (ayuda)
• Gibbons, NE (1974). «Family V. Halobacteriaceae fam. nov.». En RE Buchanan and NE Gibbons, eds., ed. Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (8th edición). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. 
• Blum P (editor). (2008). Archaea: New Models for Prokaryotic Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-27-1. [1]. 

Bases de datos científicos

• PubMed
• PubMed Central
• Google Scholar

Enlaces externos

• NCBI
• Tree of Life
• Species2000
• MicrobeWiki
• LSPN
• Correct names of taxa within the family Halobacteriaceae