PRKDC

Subunidad catalítica de la proteína cinasa dependiente de ADN
Estructuras disponibles
PDB	Buscar ortólogos: PDBe, RCSB  Estructuras enzimáticas RCSB PDB, PDBe, PDBsum
Identificadores
Símbolos	PRKDC (HGNC: 9413) DNA-PKcs; DNAPK; DNPK1; HYRC; HYRC1; XRCC7; p350
Identificadores externos	OMIM: 600899 EBI: PRKDC GeneCards: Gen PRKDC UniProt: PRKDC  Bases de datos de enzimas IntEnz: entrada en IntEnz BRENDA: entrada en BRENDA ExPASy: NiceZime view KEGG: entrada en KEEG PRIAM: perfil PRIAM ExplorEnz: entrada en ExplorEnz MetaCyc: vía metabólica
Número EC	2.7.11.1
Locus	Cr. 8 q11
Ontología génica Referencias: AmiGO / QuickGO
Estructura/Función proteica
Tamaño	4128 (aminoácidos)
Ortólogos
Especies	Humano Ratón
Entrez	5591
UniProt	P78527 n/a
RefSeq (ARNm)	NM_006904 n/a
PubMed (Búsqueda)	[1]
PMC (Búsqueda)	[2]
v t e
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La subunidad catalítica de la proteína cinasa dependiente de ADN (PRKDC) es una proteína codificada en humanos por el gen PRKDC.

Función

PRKDC es la subunidad catalítica de una serina/treonina proteína cinasa no específica nuclear dependiente de ADN denominada DNA-PK. El segundo componente es el antígeno autoinmune Ku. Esta proteína es inactiva y depende de Ku para dirigirse a los extremos del ADN y poner en funcionamiento su actividad cinasa.^[1]​ PRKDC es requerida en el proceso de recombinación no homóloga durante la reparación del ADN, que religa los cortes existentes en las dobles hebras. También es requerida en el proceso de recombinación V(D)J, un proceso que utiliza la recombinación no homóloga para promover la diversidad del sistema inmune. Ratones knockout para el gen PRKDC presentan inmunodeficiencia combinada severa debido al defecto en la recombinación V(D)J.

Se han identificado numerosas proteínas como sustratos para la actividad cinasa de PRKDC. La autofosforilación de PRKDC parece jugar un importante papel en la recombinación no homóloga y se piensa que induce un cambio conformacional que le permite a las enzimas que procesan los extremos, acceder a dichos extremos de los cortes producidos en la doble hebra de ADN.^[2]​ PRKDC también coopera con ATR y ATM para fosforilar proteínas implicadas en el ciclo celular.

Interacciones

La proteína PRKDC ha demostrado ser capaz de interaccionar con:

• NCOA6^[3]​
• CHEK1^[4]​^[5]​
• WRN^[4]​^[6]​
• RPA2^[7]​
• ILF3^[8]​
• DCLRE1C^[9]​
• ILF2^[8]​
• Ataxia telangiectasia mutada^[4]​^[10]​
• Ku80^[11]​^[12]​^[13]​
• CDC5L^[14]​
• p53^[4]​^[5]​^[15]​
• CIB1^[16]​
• C1D^[15]​
• CHUK^[17]​

Véase también

• Recombinación no homóloga
• Recombinación V(D)J
• Ku
• Proteína cinasa

Referencias

1. «Entrez Gene: PRKDC protein kinase, DNA-activated, catalytic polypeptide». 
2. Meek K, Dang V, Lees-Miller SP (2008). «DNA-PK: the means to justify the ends?». Adv. Immunol. 99: 33-58. PMID 19117531. doi:10.1016/S0065-2776(08)00602-0. 
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11. Jin, S; Kharbanda S, Mayer B, Kufe D, Weaver D T (Oct. de 1997). «Binding of Ku and c-Abl at the kinase homology region of DNA-dependent protein kinase catalytic subunit». J. Biol. Chem. (UNITED STATES) 272 (40): 24763-6. ISSN 0021-9258. PMID 9312071.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
12. Matheos, Diamanto; Ruiz Marcia T, Price Gerald B, Zannis-Hadjopoulos Maria (Oct. de 2002). «Ku antigen, an origin-specific binding protein that associates with replication proteins, is required for mammalian DNA replication». Biochim. Biophys. Acta (Netherlands) 1578 (1-3): 59-72. ISSN 0006-3002. PMID 12393188.  La referencia utiliza el parámetro obsoleto |coautores= (ayuda)
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16. Wu, X; Lieber M R (Oct. de 1997). «Interaction between DNA-dependent protein kinase and a novel protein, KIP». Mutat. Res. (NETHERLANDS) 385 (1): 13-20. ISSN 0027-5107. PMID 9372844. 
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