Durante la Revolución francesa, se incorporó al ejército del Rhin. Al retornar a Francia en 1798, se dedicó a su pasión entomología. Instalado en Lestrem, será el alcalde y miembro del Consejo General del departamento, manteniendo correspondencia con Johann W. Meigen (1764-1845). Macquart publica Diptères du Nord de la France de 1828 a 1833. En Suites à Buffon, escribió los dos volúmenes dedicados a dípteros.
A sugerencia del ornitólogo Charles Bonaparte, fue elegido miembro correspondiente de la Academia de Ciencias. En 1851 fue nombrado caballero de la Legión de Honor.
La abreviatura «Macquart» se emplea para indicar a Pierre Justin Marie Macquart como autoridad en la descripción y clasificación científica de los vegetales.[2]
Abreviatura (zoología)
La abreviaturaMacquart se emplea para indicar a Pierre Justin Marie Macquart como autoridad en la descripción y taxonomía en zoología.