Indrek Sei (sündinud 26. juulil 1972 Tallinnas) on Eesti ettevõtja ja endine ujuja.
Sei lõpetas 1991. aastal Eesti Spordigümnaasiumi ja on õppinud TTÜ majandusteaduskonnas. Ta hakkas ujumist harrastama 1979. aastal Elle Ernesaksa juhendamisel. Tallinna Kalevi ujumiskoolis olid tema treenerid Leili Hein ja Urmas Jaamul, hiljem Kalle Liivamägi ja Tõnu Meijel.
- Indrek Sei on kuulunud aastatel 1987–2002 Eesti koondisse.
- Ta on tulnud vaba-, selili-, rinnuli-, liblik-, kompleks- ja teateujumises 41 korda suvistel (1988–1991, 1993–1994, 1997–2000), 34 korda talvistel (1987–1993) ja 37 korda lühiraja meistrivõistlustel (1994–1998, 2001) Eesti meistriks.
- Aastatel 1989 ja 1991 oli ta Eesti grand prix' sarja võitja.
- Sei on parandanud lühikeses ja pikas ujulas 72 korral Eesti rekordit, sh 14 korral teateujumises.
- Indrek Sei on startinud 21 korral rahvusvahelistel tiitlivõistlusel.
- Juunioride Euroopa meistrivõistlustel võitis Sei 1989. aastal 100 m vabaujumises hõbe- ja 4 x 100 m vabaujumises Nõukogude Liidu meeskonna koosseisus kuldmedali. Ta oli aastatel 1989–1990 3-kordne Nõukogude Liidu juunioride meister.
- Sprindi Euroopa meistrivõistlustel võitis Sei 1991. aasta detsembris 100 m kompleksujumises pronksmedali, mis oli pärast taasiseseisvumist Eestile esimene suurvõistluste medal. Lisaks võitis ta samal alal pronksmedali 1992. aastal ja hõbemedali 1993. aastal.
- Maailma karikavõistlustel oli ta 1993. aastal 100 m kompleksujumises üldarvestuses teine.
- 1992 Barcelona olümpiamängudel 50 m vabaujumises 31. ja 100 m vabaujumises 32. ning 4 × 100 m kombineeritud teateujumises 15. koht.
- 1996 Atlanta olümpiamängudel 50 m vabaujumises 26. ja 100 m vabaujumises 32. koht.
- 2000 Sydney olümpiamängudel 50 m vabaujumises 29. ja 100 m vabaujumises 43. koht.
- Lühiraja maailmameistrivõistlustel 2000. aastal 50 m liblikujumises 9. ja 100 m kompleksujumises 6. koht.
Indrek Sei on spordiselts Kalevi auliige 2001. aastast. Ta on Eesti Sportlaste Ühenduse asutaja (1999), kuulunud aastatel 1999–2005 ja aastast 2009 selle juhatusse. Sei oli aastatel 2005–2008 Eesti Ujumisliidu president ning Eesti Olümpiakomitee esindajate kogu liige. Ta on Keila Swimclubi Indrek Sei Ujumiskooli juhatuse liige ning olnud tegev ettevõtja-investorina.