Seiji Mizushima (jap. 水島 精二; s. 28. tammikuuta 1966) on japanilainen televisio- ja elokuvaohjaaja. Hän on ohjannut Fullmetal Alchemistista tehdyn animen, kuten myös elokuvan Fullmetal Alchemist the Movie: Conqueror of Shamballa (2005).