Alcest est formé en 1999 à Bagnols-sur-Cèze en tant que projet solo par Stéphane Paut, alias Neige[4]. Alcest était au départ un groupe de black metal. Le groupe devient ensuite le projet solo du musicien multi-instrumentiste Neige, connu aussi pour ses autres groupes Amesoeurs, Peste noire ou encore Lantlôs.
Le premier album studio d'Alcest, Souvenirs d'un autre monde, fait l'objet de nombreux articles dans la presse musicale et les médias indépendants, notamment des webzines consacrés aux scènes underground[6],[7],[8].
Le , Alcest sort son troisième album, Les Voyages de l'âme, et son premier clip vidéo sur le single Autre temps, réalisé par Julien Marie[9]. L'album Shelter est publié le . Au début de 2014, Alcest fait partie des 10 nouveaux artistes que le magazine Rolling Stone conseille d'écouter[10].
Le , Neige annonce un nouvel album. Le , le groupe annonce sur leur page Facebook que sa sortie est prévue le . L'album s'appelle Kodama et contient 6 titres et une pochette réalisée par Førtifem. Le premier extrait, Oiseaux de proie, est dévoilé le . Le , le magazine anglais Metal Hammer cite le groupe dans son top 10 des meilleurs groupes de métal français[11]. À la fin , l'équipe de programmation du Hellfest annonce le retour du groupe pour l'édition 2017[12],[13], Alcest avait déjà joué au Hellfest en 2012[14].
Le , Alcest sort son premier album sur le label allemand Nuclear Blast. Spiritual Instinct se distingue par un retour à des sonorités plus abruptes. Le succès est immédiat, et les retours dans la presse sont unanimes quant à la qualité de ce nouveau disque[réf. nécessaire].
En , un septième album intitulé Les Chants de l'aurore est annoncé pour le [16].