C'est l'agent de la maladie des taches foliaires et d'autres maladies (souvent appelées « alternariose ») affectant de très nombreuses espèces végétales. C'est un phytopathogène opportuniste provoquant divers symptômes, taches noires, pourriture, rouille, etc. sur les différents organes de la plante.
Chez l'homme, ce champignon peut causer des infections de l'appareil respiratoire supérieur[2] et provoquer de l'asthme chez les personnes sensibles.
↑(en) Peter Wiest, « Alternaria Infection in a Patient with Acquired Immunodeficiency Syndrome: Case Report and Review of Invasive Alternaria Infections », Reviews of Infectious Diseases, The University of Chicago Press, vol. 9, no 4, , p. 799–803 (PMID3326127, JSTOR4454171).