Methanobrevibacter smithii

Classification
Domaine	Archaea
Embranchement	Euryarchaeota
Classe	Methanobacteria
Ordre	Methanobacteriales
Famille	Methanobacteriaceae
Genre	Methanobrevibacter

Methanobrevibacter smithii est une espèce d'archées méthanogènes. Ce microorganisme anaérobie obligatoire est la principale espèce d'archées du microbiote intestinal humain. Il s'agit d'une archée hydrogénotrophe, c'est-à-dire qu'elle absorbe l'hydrogène H₂ et le dioxyde de carbone CO₂, produits notamment par la fermentation bactérienne des polysaccharides, pour former du méthane CH₄ et de l'eau H₂O, ce qui augmente globalement la quantité d'énergie libérée par l'absorption des aliments^[2].

L'accumulation d'hydrogène dans l'intestin réduit l'efficacité de la fermentation microbienne ainsi que le rendement énergétique global de l'absorption des aliments. Les microorganismes qui absorbent l'hydrogène sont donc essentiels pour optimiser les processus de digestion. La flore intestinale humaine est dominée par les embranchements Bacteroidetes et Firmicutes. Elle contient essentiellement trois groupes de microorganismes absorbant l'hydrogène : les méthanogènes, dont M. smithii est la plus abondante, un groupe polyphylétique d'acétogènes, et des bactéries sulfato-réductrices. Elle présente une adaptation enzymatique à la flore intestinale, et notamment aux métabolites produits par Bacteroides thetaiotaomicron, une bactérie saccharolytique très abondante dans l'intestin^[3]. Bien que M. smithii soit bien représentée dans le tube digestif, elle l'est relativement peu dans la matière fécale humaine^[4].

Les méthanogènes peuvent représenter jusqu'à 10 % des microorganismes de la flore intestinale d'un homme adulte en bonne santé, mais cette proportion peut s'accroître chez les anorexiques, ce qui témoignerait d'une adaptation visant à optimiser l'absorption des aliments et notamment leur conversion en énergie métabolique par l'organisme ; M. smithii pourrait également être liée à la constipation, une affection fréquente chez les patients anorexiques^[2].

Notes et références

↑ (en) NCBI : Methanobrevibacter smithii (taxons inclus)
↑ ^{a et b} (en) Fabrice Armougom, Mireille Henry, Bernard Vialettes, Denis Raccah et Didier Raoult, « Monitoring Bacterial Community of Human Gut Microbiota Reveals an Increase in Lactobacillus in Obese Patients and Methanogens in Anorexic Patients », PLoS ONE, vol. 4, n^o 9,‎ 23 septembre 2009, e7125 (lire en ligne) DOI 10.1371/journal.pone.0007125
↑ (en) Buck S. Samuel, Elizabeth E. Hansen, Jill K. Manchester, Pedro M. Coutinho, Bernard Henrissat, Robert Fulton, Philippe Latreille, Kung Kim, Richard K. Wilson et Jeffrey I. Gordon, « Genomic and metabolic adaptations of Methanobrevibacter smithii to the human gut », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 104, n^o 25,‎ 4 mai 2007, p. 10643-10648 (lire en ligne) DOI
↑ (en) Bédis Dridi, Mireille Henry, Amel El Khéchine, Didier Raoult et Michel Drancourt, « High Prevalence of Methanobrevibacter smithii and Methanosphaera stadtmanae Detected in the Human Gut Using an Improved DNA Detection Protocol », PLoS ONE, vol. 4, n^o 9,‎ 17 septembre 2009, e7063 (lire en ligne) DOI 10.1371/journal.pone.0007063

Paul B. Eckburg, Paul W. Lepp, et David A. Relman Archaea and Their Potential Role in Human Disease
Heide L. Dermoumi, Rainer A.M. Ansorg Isolation and Antimicrobial Susceptibility Testing of Fecal Strains of the Archaeon Methanobrevibacter smithii Chemotherapy 2001;47:177-183 DOI 10.1159/000063219
Methanogens Photo Gallery—Methanobrevibacter smithii
LSPN page for Methanobrevibacter
Samuel BS, Hansen EE, Manchester JK, Coutinho PM, Henrissat B, Fulton R, Latreille P, Kim K, Wilson RK, Gordon JI., « Genomic and metabolic adaptations of Methanobrevibacter smithii to the human gut », Proc Natl Acad Sci U S A., vol. 104, n^o 25,‎ 2007, p. 10643–8 (PMCID 1890564). DOI 10.1073/pnas.0704189104 PMID 17563350
Vianna ME, Conrads G, Gomes BP, Horz HP., « Identification and Quantification of Archaea Involved in Primary Endodontic Infections », J Clin Microbiol., vol. 44, n^o 4,‎ 2006, p. 1274–82 (PMCID 1448633). DOI 10.1128/JCM.44.4.1274-1282.2006 PMID 16597851
Ridlon JM, McGarr SE, Hylemon PB., « Development of methods for the detection and quantification of 7alpha-dehydroxylating clostridia, Desulfovibrio vulgaris, Methanobrevibacter smithii, and Lactobacillus plantarum in human feces », Clin Chim Acta., vol. 357, n^o 1,‎ 2005, p. 55–64. DOI 10.1016/j.cccn.2005.02.004 PMID 15963794

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[1] (en) NCBI : Methanobrevibacter smithii (taxons inclus)

[10.1371/journal.pone.0007125-2] {a et b} (en) Fabrice Armougom, Mireille Henry, Bernard Vialettes, Denis Raccah et Didier Raoult, « Monitoring Bacterial Community of Human Gut Microbiota Reveals an Increase in Lactobacillus in Obese Patients and Methanogens in Anorexic Patients », PLoS ONE, vol. 4, n^o 9,‎ 23 septembre 2009, e7125 (lire en ligne) DOI 10.1371/journal.pone.0007125

[3] (en) Buck S. Samuel, Elizabeth E. Hansen, Jill K. Manchester, Pedro M. Coutinho, Bernard Henrissat, Robert Fulton, Philippe Latreille, Kung Kim, Richard K. Wilson et Jeffrey I. Gordon, « Genomic and metabolic adaptations of Methanobrevibacter smithii to the human gut », Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, vol. 104, n^o 25,‎ 4 mai 2007, p. 10643-10648 (lire en ligne) DOI

[10.1371/journal.pone.0007063-4] (en) Bédis Dridi, Mireille Henry, Amel El Khéchine, Didier Raoult et Michel Drancourt, « High Prevalence of Methanobrevibacter smithii and Methanosphaera stadtmanae Detected in the Human Gut Using an Improved DNA Detection Protocol », PLoS ONE, vol. 4, n^o 9,‎ 17 septembre 2009, e7063 (lire en ligne) DOI 10.1371/journal.pone.0007063

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