En 2021, Nipkow est lauréat du prix Herbrand « en reconnaissance de son leadership dans le développement d'Isabelle et des outils associés, résultant en des contributions clés aux fondations, à l'automatisation et à l'utilisation d'assistants de preuve dans un large éventail d'applications, ainsi que ses efforts réussis pour accroître la visibilité du raisonnement automatisé"[4].
Martin, U. et Tobias Nipkow, Proc. 8th Conference on Automated Deduction, vol. 230, Springer, coll. « Lecture Notes in Computer Science », , « Unification in Boolean Rings », p. 506–513.
Tobias Nipkow, Behavioural Implementation Concepts for Nondeterministic Data Types, vol. UMCS-87-5-3 (Ph.D. thesis), University of Manchester, coll. « Computer Science Dept. Report »,
Tobias Nipkow, « Combining Matching Algorithms: The Rectangular Case », Rewriting Techniques and Applications, 3rd Int. Conf., RTA-89, Springer Lecture Notes in Computer Science (n° 355), , p. 343–358
Tobias Nipkow, Lawrence C. Paulson et Markus Wenzel, Isabelle/HOL: a proof assistant for higher-order logic, Springer, coll. « Lecture Notes in Computer Science » (no 2283), , xiv + 226 (ISBN978-3-540-43376-7)
Tobias Nipkow et Gerwin Klein, Concrete semantics: with Isabelle/HOL, Springer, , xiii+ 298 (ISBN978-3-319-10541-3)
Thomas Hales, Mark Adams, Gertrud Bauer et Tat Dat Dang et. al., « A formal proof of the Kepler conjecture », Forum of Mathematics, Pi, vol. 5, , e2 (DOI10.1017/fmp.2017.1, lire en ligne)
↑Jasmin Blanchette, « Message from the New Editor-in-Chief », Journal of Automated Reasoning, vol. 65, no 2, , p. 155 (DOI10.1007/s10817-021-09587-y).