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L'échantillonnage de Gibbs est une méthode MCMC. Étant donné une distribution de probabilité π sur un univers Ω, cet algorithme définit une chaîne de Markov dont la distribution stationnaire est π. Il permet ainsi de tirer aléatoirement un élément de Ω selon la loi π (on parle d'échantillonnage).
Comme pour toutes les méthodes de Monte-Carlo à chaîne de Markov,
La spécificité de l'échantillonnage de Gibbs consiste à « découper » qx(i) en n probabilités conditionnelles :
On remplace donc le problème de génération aléatoire de x(i + 1) par n problèmes que l'on espère plus simples.
Soit X=(Xi, i∈S) une variable de loi π dans l'espace de sites S=⟦1;n⟧ vers l'espace des états Ω. Pour x = (x1;…;xn)∈Ω et les densités conditionnelles πi(xi|x¬i) où x¬i = (xj, j≠i), i∈S, on construit l'échantillonneur de Gibbs sur les noyaux π-invariants : Pi(x,y) = πi(yi|x¬i)1(x¬i = y¬i).
On visite S séquentiellement, en relaxant à chaque pas i la valeur suivant la loi πi conditionnelle à l'état courant. La transition de x à y s'écrit:
Soit ν une probabilité jamais nulle sur S. À chaque pas, un site i est choisi avec la probabilité νi>0 et la valeur y est relaxée selon la loi conditionnelle πi à l'état courant. La transition s'écrit:
C. Gaetan et X. Guyon, chap. 9 « Simulation des modèles spatiaux », dans Jean-Jacques Droesbeke, Michel Lejeune et Gilbert Saporta, Analyse statistique des données spatiales : 10e Journées d'étude en statistique, 4-8 novembre 2002, Marseille, Société française de statistique, Paris, Technip, , 468 p. (ISBN 978-2-7108-0873-2, BNF 40225776)