Jepang awalnya melekat pada pantai timur benua Eurasia. Lempeng subduksi, menjadi lebih dalam dari lempeng Eurasia, menarik Jepang ke arah timur, membuka Laut Jepang sekitar 15 juta tahun yang lalu.[1]Selat Tartary dan Selat Korea dibuka jauh kemudian.
Pecahnya Rodinia sekitar 750 juta tahun yang lalu membentuk samudra Panthalassa, dengan bebatuan yang akhirnya menjadi Jepang berada di tepi timurnya. Pada Silur Awal (450 juta tahun yang lalu),[2] penunjaman lempeng samudera dimulai, dan proses ini berlanjut hingga hari ini, membentuk orogeni dengan lebar kira-kira 400 km di batas konvergen. Beberapa (9 atau 10) lempeng samudera tersubduksi seluruhnya dan sisa-sisanya telah membentuk sabuk metamorf berpasangan. Subduksi lengkap terbaru dari sebuah lempeng adalah yang terjadi di Lempeng Izanagi 95 juta tahun yang lalu. Saat ini Lempeng Laut Filipina menunjam di bawah Lempeng Amurian kontinental dan Lempeng Okinawa ke selatan dengan kecepatan 4 cm/tahun, membentuk Palung Nankai dan Palung Ryukyu. Lempeng Pasifik menunjam di bawah Lempeng Okhotsk ke utara dengan kecepatan 10 cm/tahun. Tahap awal subduksi-akresi telah mendaur ulang margin kerak benua beberapa kali, meninggalkan sebagian besar kepulauan Jepang modern yang terdiri dari batuan yang terbentuk pada periode Permian atau setelahnya.
Sekitar 23 juta tahun yang lalu, Jepang bagian barat adalah wilayah pesisir benua Eurasia. Lempeng subduksi, menjadi lebih dalam dari lempeng Eurasia, menarik bagian Jepang yang menjadi wilayah Chūgoku dan Kyushu modern ke timur, membuka Laut Jepang (bersamaan dengan Laut Okhotsk) pada sekitar 15-20 juta tahun yang lalu, dengan kemungkinan keadaan danau air tawar sebelum laut masuk.[3] Sekitar 16 juta tahun yang lalu, pada periode Miosen, sebuah semenanjung yang melekat pada pantai timur benua Eurasia terbentuk dengan baik. Sekitar 11 juta tahun sebelumnya, bagian Jepang yang menjadi Tōhoku dan Hokkaido modern secara bertahap terangkat dari dasar laut, dan terran dari wilayah Chūbu secara bertahap bertambah dari rantai pulau yang bertabrakan. Selat Tartary dan Selat Korea dibuka jauh kemudian, sekitar 2 juta tahun yang lalu. Pada saat yang sama, subduksi yang parah dari graben Fossa Magna telah membentuk Dataran Kantō.[4]
Perubahan bentuk daratan Jepang dari waktu ke waktu
Kepulauan Jepang, Laut Jepang dan bagian sekitarnya dari benua Asia Timur pada Miosen Awal (23-18 Ma)
Kepulauan Jepang, Laut Jepang dan bagian sekitarnya dari benua Asia Timur pada Pliosen Tengah hingga Pliosen Akhir (3,5-2 Ma)
Kepulauan Jepang pada Glasial Maksimum Terakhir sekitar 20.000 tahun yang lalu, garis hitam tipis menunjukkan garis pantai masa kini
Secara keseluruhan, komposisi geologis Jepang kurang dipahami. Kepulauan Jepang terbentuk dari beberapa unit geologi yang sejajar dengan front subduksi. Bagian pulau yang menghadap lempeng samudera biasanya lebih muda dan menampilkan proporsi produk vulkanik yang lebih besar, sedangkan bagian yang menghadap ke Laut Jepang sebagian besar merupakan endapan sedimen yang terpatahkan dan terlipat. Di barat laut Jepang, endapan kuarter yang tebal membuat penentuan sejarah geologi menjadi sangat sulit.[5]
Jepang terletak di zona vulkanik di Cincin Api Pasifik. Getaran bumi intensitas rendah yang sering dan aktivitas vulkanik sesekali dirasakan di seluruh pulau. Gempa destruktif, sering mengakibatkan tsunami, terjadi beberapa kali dalam satu abad. Gempa besar terbaru termasuk gempa bumi dan tsunami Tōhoku 2011, gempa bumi Chūetsu 2004 dan gempa bumi besar Hanshin 1995. Sumber air panas sangat banyak dan telah dikembangkan sebagai resor.
^connelly@geo.arizona.edu. "Southwest Japan". geo.arizona.edu. Diarsipkan dari versi asli tanggal October 10, 2017. Diakses tanggal July 16, 2017.Parameter |url-status= yang tidak diketahui akan diabaikan (bantuan)