SARSコロナウイルス2-ゼータ株
SARSコロナウイルス2-ゼータ株（サーズコロナウイルスツー ゼータかぶ、英語: SARS-CoV-2 Zeta variant、別名: 系統 P.2、系統 B.1.1.28.2、20B/S.484K）は、新型コロナウイルス感染症 (COVID-19) の原因ウイルスとして知られるSARSコロナウイルス2 (SARS-CoV-2) の変異株である。ブラジルのリオデジャネイロ州で最初に検出された。
世界保健機関 (WHO) は注目すべき変異株 (VOI) に指定し、WHOラベルではゼータ株 (Zeta variant) に分類していた[1]が、2021年7月にVOIから除外された[1][2][3]。
E484K変異は含まれているが、N501Y及びK417T変異は含まれていない。また、マナウスのガンマ株（系統 P.1）に直接関係することはなく、リオデジャネイロで独立して進化したと考えられる[4][5]。
分類
[編集]命名
[編集]2020年4月、この系統がブラジルのリオデジャネイロ州で初めて記録され、後に系統 P.2 (lineage P.2) と命名された[1][6]。2021年5月末、WHOは懸念される変異株 (VOC) や注目すべき変異株 (VOI) にギリシャ文字を使用する新しい方針を導入した後、系統 P.2に対しゼータ (ζ:Zeta) のラベルを割り当てた[1][6]。
変異
[編集]ゼータ株のゲノムには、E484K・D614G・V1176Fの3つのアミノ酸変異があり、これらはすべてウイルスのスパイクタンパク質コードに含まれている[7]。アメリカ疾病予防管理センター (CDC) によると、F565Lはすべてではないが、一部のゼータ変異株配列で検出されている[8]。
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![スパイクタンパク質に焦点を当てたSARS-CoV-2のゲノムマップ上にプロットされたゼータ株のアミノ酸変異[7]。](//upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/8/83/SARS-CoV-2_Zeta_variant.svg/4586px-SARS-CoV-2_Zeta_variant.svg.png)
スパイクタンパク質に焦点を当てたSARS-CoV-2のゲノムマップ上にプロットされたゼータ株のアミノ酸変異[7]。
![スパイクタンパク質に焦点を当てたSARS-CoV-2のゲノムマップ上にプロットされたゼータ株のアミノ酸変異[7]。](/wiki/%E3%83%95%E3%82%A1%E3%82%A4%E3%83%AB:SARS-CoV-2_Zeta_variant.svg)
脚注
[編集]- ^ a b c d “Tracking SARS-CoV-2 variants” (英語). who.int. World Health Organization. 2021年10月1日閲覧。
- ^ 感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規変異株について （第11報） - 国立感染症研究所 (2021年7⽉17⽇) 、2021年8月15日閲覧。
- ^ “当センターにおける新型コロナウイルス変異株のスクリーニング検査結果について（2021年10月12日更新）”. 東京都健康安全研究センター. 2021年10月13日時点のオリジナルよりアーカイブ。2021年10月13日閲覧。
- ^ “PANGO lineages Lineage P.2”. COV lineages. 28 January 2021閲覧。 “P.2… Alias of B.1.1.28.2, Brazilian lineage”
- ^ Voloch, Carolina M.; da Silva Francisco, Ronaldo; de Almeida, Luiz G. P.; Cardoso, Cynthia C.; Brustolini, Otavio J.; Gerber, Alexandra L.; Guimarães, Ana Paula de C.; Mariani, Diana et al. (2021-04-26). “Genomic Characterization of a Novel SARS-CoV-2 Lineage from Rio de Janeiro, Brazil”. Journal of Virology 95 (10). doi:10.1128/JVI.00119-21. ISSN 0022-538X. PMC 8139668. PMID 33649194.
- ^ a b “新型コロナウイルス感染症の世界の状況報告”. 厚生労働省. (2021年6月8日) 2021年10月2日閲覧。
- ^ a b “Spike Variants: Zeta variant, aka P.2”. covdb.stanford.edu. Stanford University Coronavirus Antiviral & Resistance Database (1 July 2021). 2021年7月5日閲覧。
- ^ “SARS-CoV-2 Variant Classifications and Definitions”. CDC.gov. Centers for Disease Control and Prevention. 5 July 2021閲覧。
関連項目
[編集]- 懸念される変異株
- SARSコロナウイルス2の変異株
- SARSコロナウイルス2-アルファ株
- SARSコロナウイルス2-ベータ株
- SARSコロナウイルス2-ガンマ株 - 同じく最初にブラジルで流行した株。
- SARSコロナウイルス2-デルタ株
- SARSコロナウイルス2-シータ株
- SARSコロナウイルス2-ラムダ株 - 最初にペルーで確認され、特に南米で流行している株。
- SARSコロナウイルス2-ミュー株 - 最初にコロンビアで確認された株。
- SARSコロナウイルス2-オミクロン株
- 南北アメリカにおける2019年コロナウイルス感染症の流行状況
外部リンク
[編集]- Tracking SARS-CoV-2 variants - 世界保健機関 (WHO)
- Variants of the Virus - アメリカ疾病予防管理センター (CDC)
- Lineage P.2 - Cov-Lineages
- Zeta Variant Report - outbreak.info
- 新型コロナウイルス感染症について - 厚生労働省
- 新型コロナウイルス感染症に関する報道発表資料 変異株 - 厚生労働省
- 新型コロナウイルス感染症（COVID-19）関連情報 - 国立感染症研究所
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