Klutepapir eller fillepapir er trefritt papir fremstilt av tekstilfibre som lin, jute, hamp og bomull. Da etterspørselen etter papir steg på 1800-tallet, ble cellulose som var utvunnet av trevirke den viktigste råstoffkilden for papir.
Klutepapir er solid og aldringsbestandig, og brukes til pengesedler og som dokumentpapir.
Finere, håndlagd papir kan også kalles bøttepapir, oppkalt etter det karet, bøtta, der papirmassen røres ut før den legges på rammer for tørking til ark.
Klutepapir kalles kludepapir på dansk, ragged paper på engelsk og lumpenpapier på tysk.