Jolly jest pamiętany za pionierskie badania nad miastenią, na której określenie wprowadził termin myasthenia gravis pseudoparalytica. Napisał też cenioną monografię poświęconą hipochondrii, opublikowaną w podręczniku Ziemssena(inne języki).
Ueber familiale Irrenpflege in Schottland[5] (1875)
Hysterie und Hypochondrie. W: Handbuch der speciellen Pathologie und Therapie. Leipzig, 1877.
Hypochondrie. [w:] Handbuch der speciellen Pathologie und Therapie. Leipzig, 1877, 1878, ss. 203-308
Vorgeschichte und gegenwärtige Einrichtung der Psychiatrischen Klinik in Strassburg. Rede zur Feier der Eröffnung des Neubaus der Klinik. Strassburg, K.J.Tübner, 1887
Untersuchungen über den elektrischen Leitungswiderstand des menschlichen Körpers. Strassburg, K.J.Tübner, 1887
Über Irrthum und Irrsinn. Rede, gehalten zur Feier des Stiftungstages der militärärztlichen Bildungsanstalten. Berlin, A. Hirschwald, 1893.
↑Siemerling E. Zur Erinnerung an Friedrich Jolly. A. Hirschwald, Berlin 1904
↑Henneberg. Friedrich Jolly†. Centralblatt für Nervenheilkunde und Psychiatrie 27 (14), s. 156–160 (1904)
↑FriedrichF.JollyFriedrichF., Ueber multiple Hirnsklerose, „Archiv für Psychiatrie und Nervenkrankheiten”, 3 (3), 1872, s. 711–730, DOI: 10.1007/BF02166458, ISSN0003-9373(niem.).
↑FriedrichF.JollyFriedrichF., Beiträge zur Theorie der Hallucination, „Archiv für Psychiatrie und Nervenkrankheiten”, 4 (3), 1874, s. 495–539, DOI: 10.1007/BF02155947, ISSN0003-9373(niem.).
↑FriedrichF.JollyFriedrichF., Ueber familiale Irrenpflege in Schottland, „Archiv für Psychiatrie und Nervenkrankheiten”, 5 (1), 1875, s. 164–188, DOI: 10.1007/BF01949295, ISSN0003-9373(niem.).