Рибосомний білок SA

Рибосомний білок SA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BCH, 4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4UJE, 4D5L, 4UJD, 5FLX, 4D61
Ідентифікатори
Символи	RPSA, 37LRP, 67LR, ICAS, LAMBR, LAMR1, LBP, LBP/p40, LRP, LRP/LR, NEM/1CHD4, SA, lamR, p40, Ribosomal protein SA
Зовнішні ІД	OMIM: 150370 MGI: 105381 HomoloGene: 68249 GeneCards: RPSA
Пов'язані генетичні захворювання
isolated congenital asplenia[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • virus receptor activity • structural constituent of ribosome • ribosome binding • laminin receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • laminin binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • рибосома • мембрана • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • small ribosomal subunit • екзосома • клітинне ядро • 90S preribosome • нуклеоплазма • cytosolic small ribosomal subunit Біологічний процес • endonucleolytic cleavage to generate mature 3'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) • viral transcription • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • translational initiation • rRNA export from nucleus • viral entry into host cell • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • Біосинтез білків • GO:0022415 viral process • rRNA processing • ribosomal small subunit assembly • адгезія клітин • cytoplasmic translation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3921	16785
Ensembl	ENSG00000168028	ENSMUSG00000032518
UniProt	P08865	P14206
RefSeq (мРНК)	NM_002295 NM_001304288	NM_011029
RefSeq (білок)	NP_001291217 NP_002286	NP_035159
Локус (UCSC)	Хр. 3: 39.41 – 39.41 Mb	Хр. 9: 119.96 – 119.96 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Рибосомний білок SA (англ. Ribosomal protein SA) – білок, який кодується геном RPSA, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 295 амінокислот, а молекулярна маса — 32 854^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSGALDVLQM		KEEDVLKFLA		AGTHLGGTNL		DFQMEQYIYK		RKSDGIYIIN
LKRTWEKLLL		AARAIVAIEN		PADVSVISSR		NTGQRAVLKF		AAATGATPIA
GRFTPGTFTN		QIQAAFREPR		LLVVTDPRAD		HQPLTEASYV		NLPTIALCNT
DSPLRYVDIA		IPCNNKGAHS		VGLMWWMLAR		EVLRMRGTIS		REHPWEVMPD
LYFYRDPEEI		EKEEQAAAEK		AVTKEEFQGE		WTAPAPEFTA		TQPEVADWSE
GVQVPSVPIQ		QFPTEDWSAQ		PATEDWSAAP		TAQATEWVGA		TTDWS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків, рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Terranova V.P., Rao C.N., Kalebic T., Margulies I.M., Liotta L.A. (1983). Laminin receptor on human breast carcinoma cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80: 444—448. PMID 6300843 DOI:10.1073/pnas.80.2.444
• Cioce V., Margulies I.M.K., Sobel M.E., Castronovo V. (1993). Interaction between the 67 kilodalton metastasis-associated laminin receptor and laminin. Kidney Int. 43: 30—37. PMID 8433567 DOI:10.1038/ki.1993.7
• Rieger R., Edenhofer F., Lasmezas C.I., Weiss S. (1997). The human 37-kDa laminin receptor precursor interacts with the prion protein in eukaryotic cells. Nat. Med. 3: 1383—1388. PMID 9396609 DOI:10.1038/nm1297-1383
• Sato M., Saeki Y., Tanaka K., Kaneda Y. (1999). Ribosome-associated protein LBP/p40 binds to S21 protein of 40S ribosome: analysis using a yeast two-hybrid system. Biochem. Biophys. Res. Commun. 256: 385—390. PMID 10079194 DOI:10.1006/bbrc.1999.0343
• Kazmin D.A., Hoyt T.R., Taubner L., Teintze M., Starkey J.R. (2000). Phage display mapping for peptide 11 sensitive sequences binding to laminin-1. J. Mol. Biol. 298: 431—445. PMID 10772861 DOI:10.1006/jmbi.2000.3680

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з Рибосомний білок SA переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6502 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.
5. UniProt, P08865 (англ.) . Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»