Ở mùa giải 2018-19, Lage được bổ nhiệm làm huấn luyện viên tạm quyền của Benfica, thay thế cho Rui Vitória vào ngày 3 tháng 1 năm 2019.[5][6] Ngay trong lần đầu dẫn dắt đội bóng, Lage cùng Benfica đã có được chiến thắng 4–2 trên sân nhà trước Rio Ave vào ngày 6 tháng 1, và Lage được bổ nhiệm chính thức 8 ngày sau đó.[7][8]
Vào ngày 10 tháng 2, sau khi giành chiến 2 chiến thắng liên tiếp ở trận derby Lisbon – bao gồm một chiến thắng 4-2 ở giải quốc nội [9][10] – Lage cùng Benfica đã tạo nên chiến thắng với cách biệt lớn nhất ở Giải bóng đá Ngoại hạng Bồ Đào Nha kể từ năm 1964, một chiến thắng huỷ diệt 10-0 trước Nacional,[11][12][13] họ cũng thiết lập nên kỉ lục chiến thắng với cách biệt lớn nhất trên Sân vận động Ánh sáng mới.[14] Ở trận debut UEFA Europa League của Lage, Benfica có lần đầu tiên chiến thắng ở Thổ Nhĩ Kỳ trong lịch sử đội bóng, họ đã đánh bại Galatasaray 2-1 ở lượt đi vòng 32 đội.[15][16]
Với việc Benfica có được chiến thắng 2-1 trong trận siêu kinh điển Bồ Đào Nha ngày 2 tháng 3 năm 2019, Lage đã cân bằng được thành tích thắng 3 trận đối đầu với các kình địch Sporting and Porto của Rui Vitoria.[17] Từ vòng 16 đến vòng 34, Lage đã có được tới 18 chiến thắng cùng 1 trận hoà, qua đó chinh phục được chiếc cúp lớn đầu tiên trong sự nghiệp cầm quân của ông - danh hiệu vô địch Giải bóng đá Ngoại hạng Bồ Đào Nha. Với tỉ lệ chiến thắng lên tới 94%, Lage đã vượt qua kỉ lục của Jimmy Hagan ở Benfica, ông cùng Benfica cũng đạt được một kỉ lục vô tiền khoáng hậu - thành tích lượt về tốt nhất trong lịch sử Primera Liga với 49 điểm. Ngoài ra, Lage cũng cân bằng được kỉ lục của Sven-Göran Eriksson mùa 1990-91 khi đánh bại cả Porto, Sporting, và Braga trên sân khách trong cùng một mùa giải. Ông cũng đã cân bằng kỉ lục số bàn thắng nhiều nhất trong một mùa giải của Benfica với 103 bàn mùa 1963-64.[18]
Sau đó, Lage bắt đầu mùa giải thứ hai với Benfica bằng một chiến thắng 5-0 trước Porto ở Siêu cúp Bồ Đào Nha.[19] Ngày 17 tháng 9, ông có trận debut ở UEFA Champions League đối đầu với RB Leipzig, nhưng Benfica của Lage đã để thua 2-1 trong trận đấu đó, qua đó nối dài thành tích bết bát của Benfica ở đấu trường này lên 11 trận thua trong 14 trận gần nhất.[20]
Ngày 29 tháng 6 năm 2020, Lage rời Benfica sau khi chỉ có 2 chiến thắng sau 13 trận[21][22], và lập nên kỉ lục 5 trận liên tiếp không thắng trên sân Estadio da Luz, trong đó có cả các thất bại trước Braga và Santa Clara. Lage bị thay thế bởi trợ lý của ông, Nélson Veríssimo vào ngày 30 tháng 6 và chấm dứt hợp đồng với Benfica vào ngày 4 tháng 7 cùng năm.[23]
Tháng 6 năm 2021, Lage là một trong các ứng viên để ngồi lên chiếc ghế nóng mà Nuno Espírito Santo để lại ở Wolverhampton Wanderers. Lage cần phải tham dự một phiên điều trần để được cấp giấy phép lao động tại Anh, lý do là bởi ông chưa đủ điều kiện để được tự động cấp giấy phép lao động tại Anh thời hậu-Brexit.[24] Lage sau đó thành công được cấp giấy phép lao động[25] , và vào ngày 9 tháng 6, Lage chính thức được bổ nhiệm làm huấn luyện viên trưởng của Wolves.[26][27]
Ngày 14 tháng 8 năm 2021, Wolves của Lage nhận thất bại 1-0 trước Leicester City trong trận debut của ông và cũng là trận mở màn mùa giải 2021/22.[28]
Con trai của Lage, Jaime (ra đời tháng 4 năm 2015), được đặt tên theo Jaime Graça, người có nhiều ảnh hưởng với Lage trong vai trò là một người thầy.[29] Em trai của Lage, Luís Nascimento, cũng là một huấn luyện viên.[30]
^“Comunicado” [Announcement] (PDF). CMVM (bằng tiếng Bồ Đào Nha). S.L. Benfica. 14 tháng 1 năm 2019. Bản gốc(PDF) lưu trữ ngày 14 tháng 1 năm 2019. Truy cập ngày 8 tháng 9 năm 2021.
^“Bruno Lage iguala registo de mais três” [Bruno Lage equals record of three other]. A Bola (bằng tiếng Bồ Đào Nha). 7 tháng 2 năm 2019. Bản gốc lưu trữ ngày 22 tháng 5 năm 2021. Truy cập ngày 11 tháng 2 năm 2019.
^“Maior goleada da nova Luz começou com o golo mais rápido” [Biggest thrashing at the new Estádio da Luz started with the fastest goal]. A Bola (bằng tiếng Bồ Đào Nha). 10 tháng 2 năm 2019. Bản gốc lưu trữ ngày 22 tháng 5 năm 2021. Truy cập ngày 11 tháng 2 năm 2019.
^“Os números e os recordes de Bruno Lage” [Bruno Lage's numbers and records]. A Bola (bằng tiếng Bồ Đào Nha). 19 tháng 5 năm 2019. Bản gốc lưu trữ ngày 19 tháng 5 năm 2019. Truy cập ngày 19 tháng 5 năm 2019.
^“Benfica negoceia rescisão com Bruno Lage” [Benfica negotiates termination with Bruno Lage]. Renascença (bằng tiếng Bồ Đào Nha). 30 tháng 6 năm 2020. Truy cập ngày 4 tháng 7 năm 2020.
^Melo, Rui Miguel (16 tháng 2 năm 2019). “A história de Bruno Nascimento, o Lage que revolucionou o Benfica” [The story of Bruno Nascimento, the Lage who has revolutionised Benfica]. A Bola (bằng tiếng Bồ Đào Nha). tr. 5–9.