Manuel Pinto da Costa (sündinud 5. augustil 1937) on São Tomé ja Príncipe poliitik, kes oli 3. septembrist 2011 kuni 3. septembrini 2016 São Tomé ja Príncipe president.
Manuel Pinto da Costa oli ka São Tomé ja Príncipe esimene president. Ta oli ametis 12. juulist 1975 kuni 4. märtsini 1991.
Ta on õppinud majandusteadust, muu hulgas Saksa DV-s.
Aastatel 1975–2011 oli ta kuni 1990. aastani ainuparteina võimul olnud São Tomé ja Príncipe Vabastusliikumise liige.
7. augustil 2011 peetud valimiste teises voorus valiti ta sõltumatu kandidaadina uuesti presidendiks.