Microhyla borneensis est une espèce d'amphibiens de la famille des Microhylidae[1].
Cette espèce est endémique du Sarawak en Malaisie orientale sur l'île de Bornéo. Elle se rencontre à environ 300 m d'altitude dans le parc national Kubah[1].
Son nom d'espèce, composé de borne[o] et du suffixe latin -ensis, « qui vit dans, qui habite », lui a été donné en référence au lieu de sa découverte, Bornéo.