CCR9

CCR9
Ідентифікатори
Символи	CCR9, CC-CKR-9, CDw199, GPR-9-6, GPR28, C-C motif chemokine receptor 9
Зовнішні ІД	OMIM: 604738 MGI: 1341902 HomoloGene: 22546 GeneCards: CCR9
Реагує на сполуку
vercirnon[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • C-C chemokine receptor activity • G protein-coupled receptor activity • signal transducer activity • chemokine receptor activity • chemokine binding • C-C chemokine binding Клітинна компонента • cell surface • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • external side of plasma membrane Біологічний процес • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • хемотаксис • chemokine-mediated signaling pathway • cellular defense response • G protein-coupled receptor signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • CD8-positive, gamma-delta intraepithelial T cell differentiation • calcium-mediated signaling • cell chemotaxis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10803	12769
Ensembl	ENSG00000173585	ENSMUSG00000029530
UniProt	P51686	Q9WUT7
RefSeq (мРНК)	NM_001256369 NM_006641 NM_031200 NM_001386447 NM_001386448	NM_001166625 NM_009913
RefSeq (білок)	NP_001243298 NP_006632 NP_112477	NP_001160097 NP_034043
Локус (UCSC)	Хр. 3: 45.89 – 45.9 Mb	Хр. 9: 123.51 – 123.61 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCR9 (англ. C-C motif chemokine receptor 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 369 амінокислот, а молекулярна маса — 42 016^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTPTDFTSPI		PNMADDYGSE		STSSMEDYVN		FNFTDFYCEK		NNVRQFASHF
LPPLYWLVFI		VGALGNSLVI		LVYWYCTRVK		TMTDMFLLNL		AIADLLFLVT
LPFWAIAAAD		QWKFQTFMCK		VVNSMYKMNF		YSCVLLIMCI		SVDRYIAIAQ
AMRAHTWREK		RLLYSKMVCF		TIWVLAAALC		IPEILYSQIK		EESGIAICTM
VYPSDESTKL		KSAVLTLKVI		LGFFLPFVVM		ACCYTIIIHT		LIQAKKSSKH
KALKVTITVL		TVFVLSQFPY		NCILLVQTID		AYAMFISNCA		VSTNIDICFQ
VTQTIAFFHS		CLNPVLYVFV		GERFRRDLVK		TLKNLGCISQ		AQWVSFTRRE
GSLKLSSMLL		ETTSGALSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Yu C.-R., Peden K.W.C., Zaitseva M.B., Golding H., Farber J.M. (2000). CCR9A and CCR9B: two receptors for the chemokine CCL25/TECK/Ck beta-15 that differ in their sensitivities to ligand. J. Immunol. 164: 1293—1305. PMID 10640743 doi:10.4049/jimmunol.164.3.1293
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
• Zaballos A., Gutierrez J., Varona R., Ardavin C., Marquez G. (1999). Identification of the orphan chemokine receptor GPR-9-6 as CCR9, the receptor for the chemokine TECK. J. Immunol. 162: 5671—5675. PMID 10229797

Примітки

1. Сполуки, які фізично взаємодіють з C-C motif chemokine receptor 9 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1610 (англ.) . Архів оригіналу за 14 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-14 у Wayback Machine.]
5. UniProt, P51686 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»