CDH5

CDH5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KOH
Ідентифікатори
Символи	CDH5, 7B4, CD144, VE-cadherin, cadherin 5
Зовнішні ІД	OMIM: 601120 MGI: 105057 HomoloGene: 1359 GeneCards: CDH5
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • beta-catenin binding • transmembrane transporter binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein phosphatase binding • signaling receptor binding • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding • vascular endothelial growth factor receptor 2 binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • cell-cell junction • bicellular tight junction • Адгезивні контакти • cell surface • міжклітинні контакти • external side of plasma membrane • cell periphery • клітинна мембрана • catenin complex Біологічний процес • positive regulation of establishment of endothelial barrier • адгезія клітин • cell-cell junction assembly • adherens junction organization • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • regulation of establishment of cell polarity • negative regulation of cell population proliferation • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • blood vessel maturation • cell-cell adhesion • negative regulation of inflammatory response • positive regulation of angiogenesis • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • cell-cell adhesion mediated by cadherin • GO:0000767 cell morphogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1003	12562
Ensembl	ENSG00000179776	ENSMUSG00000031871
UniProt	P33151	P55284
RefSeq (мРНК)	NM_001114117 NM_001795	NM_009868
RefSeq (білок)	NP_001786	NP_033998
Локус (UCSC)	Хр. 16: 66.37 – 66.4 Mb	Хр. 8: 104.83 – 104.87 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH5 (англ. Cadherin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот, а молекулярна маса — 87 528^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQRLMMLLAT		SGACLGLLAV		AAVAAAGANP		AQRDTHSLLP		THRRQKRDWI
WNQMHIDEEK		NTSLPHHVGK		IKSSVSRKNA		KYLLKGEYVG		KVFRVDAETG
DVFAIERLDR		ENISEYHLTA		VIVDKDTGEN		LETPSSFTIK		VHDVNDNWPV
FTHRLFNASV		PESSAVGTSV		ISVTAVDADD		PTVGDHASVM		YQILKGKEYF
AIDNSGRIIT		ITKSLDREKQ		ARYEIVVEAR		DAQGLRGDSG		TATVLVTLQD
INDNFPFFTQ		TKYTFVVPED		TRVGTSVGSL		FVEDPDEPQN		RMTKYSILRG
DYQDAFTIET		NPAHNEGIIK		PMKPLDYEYI		QQYSFIVEAT		DPTIDLRYMS
PPAGNRAQVI		INITDVDEPP		IFQQPFYHFQ		LKENQKKPLI		GTVLAMDPDA
ARHSIGYSIR		RTSDKGQFFR		VTKKGDIYNE		KELDREVYPW		YNLTVEAKEL
DSTGTPTGKE		SIVQVHIEVL		DENDNAPEFA		KPYQPKVCEN		AVHGQLVLQI
SAIDKDITPR		NVKFKFILNT		ENNFTLTDNH		DNTANITVKY		GQFDREHTKV
HFLPVVISDN		GMPSRTGTST		LTVAVCKCNE		QGEFTFCEDM		AAQVGVSIQA
VVAILLCILT		ITVITLLIFL		RRRLRKQARA		HGKSVPEIHE		QLVTYDEEGG
GEMDTTSYDV		SVLNSVRRGG		AKPPRPALDA		RPSLYAQVQK		PPRHAPGAHG
GPGEMAAMIE		VKKDEADHDG		DGPPYDTLHI		YGYEGSESIA		ESLSSLGTDS
SDSDVDYDFL		NDWGPRFKML		AELYGSDPRE		ELLY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 DOI:10.1042/0264-6021:3490159
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Ali J., Liao F., Martens E., Muller W.A. (1997). Vascular endothelial cadherin (VE-cadherin): cloning and role in endothelial cell-cell adhesion. Microcirculation. 4: 267—277. PMID 9219219
• Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1764 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
4. UniProt, P33151 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 16

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»