CXCR6

CXCR6
Ідентифікатори
Символи	CXCR6, BONZO, CD186, STRL33, TYMSTR, C-X-C motif chemokine receptor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 605163 MGI: 1934582 HomoloGene: 38197 GeneCards: CXCR6
Онтологія гена Молекулярна функція • C-X-C chemokine receptor activity • C-X-C chemokine binding • G protein-coupled receptor activity • chemokine receptor activity • signal transducer activity • coreceptor activity • C-C chemokine receptor activity • chemokine binding • C-C chemokine binding Клітинна компонента • integral component of membrane • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • мембрана • внутрішньоклітинний • external side of plasma membrane Біологічний процес • viral genome replication • хемотаксис • chemokine-mediated signaling pathway • G protein-coupled receptor signaling pathway • inflammatory response • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration • calcium-mediated signaling • cell chemotaxis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10663	80901
Ensembl	ENSG00000172215	ENSMUSG00000048521
UniProt	O00574	Q9EQ16
RefSeq (мРНК)	NM_006564	NM_030712
RefSeq (білок)	NP_006555	NP_109637
Локус (UCSC)	Хр. 3: 45.94 – 45.95 Mb	Хр. 9: 123.64 – 123.64 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CXCR6 (англ. C-X-C motif chemokine receptor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 342 амінокислот, а молекулярна маса — 39 280^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEHDYHEDY		GFSSFNDSSQ		EEHQDFLQFS		KVFLPCMYLV		VFVCGLVGNS
LVLVISIFYH		KLQSLTDVFL		VNLPLADLVF		VCTLPFWAYA		GIHEWVFGQV
MCKSLLGIYT		INFYTSMLIL		TCITVDRFIV		VVKATKAYNQ		QAKRMTWGKV
TSLLIWVISL		LVSLPQIIYG		NVFNLDKLIC		GYHDEAISTV		VLATQMTLGF
FLPLLTMIVC		YSVIIKTLLH		AGGFQKHRSL		KIIFLVMAVF		LLTQMPFNLM
KFIRSTHWEY		YAMTSFHYTI		MVTEAIAYLR		ACLNPVLYAF		VSLKFRKNFW
KLVKDIGCLP		YLGVSHQWKS		SEDNSKTFSA		SHNVEATSMF		QL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Deng H.K., Unutmaz D., Kewalramani V.N., Littman D.R. (1997). Expression cloning of new receptors used by simian and human immunodeficiency viruses. Nature. 388: 296—300. PMID 9230441 DOI:10.1038/40894
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16647 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
4. UniProt, O00574 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 3

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»