DDR1

DDR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3ZOS, 4AG4, 4BKJ, 4CKR, 5BVK, 5BVN, 5BVO, 5BVW, 5FDP
Ідентифікатори
Символи	DDR1, CAK, CD167, DDR, EHGK2, MCK10, NEP, NTRK4, PTK3, PTK3A, RTK6, TRKE, discoidin domain receptor tyrosine kinase 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600408 MGI: 99216 HomoloGene: 68212 GeneCards: DDR1
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • nucleotide binding • protein kinase activity • collagen binding • зв'язування з іоном металу • kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity • protein tyrosine kinase collagen receptor activity • protein tyrosine kinase activity • ATP binding • receptor tyrosine kinase Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • receptor complex • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір Біологічний процес • collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway • branching involved in mammary gland duct morphogenesis • фосфорилювання • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • жіноча вагітність • extracellular matrix organization • ear development • mammary gland alveolus development • regulation of extracellular matrix disassembly • smooth muscle cell migration • smooth muscle cell-matrix adhesion • regulation of cell-matrix adhesion • protein phosphorylation • адгезія клітин • regulation of cell growth • peptidyl-tyrosine phosphorylation • лактація • wound healing, spreading of cells • embryo implantation • negative regulation of cell population proliferation • peptidyl-tyrosine autophosphorylation • protein autophosphorylation • axon development • neuron projection extension • cell-matrix adhesion • positive regulation of cell population proliferation • диференціація клітин • regulation of extracellular matrix organization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	780	12305
Ensembl	ENSG00000215522 ENSG00000137332 ENSG00000229767 ENSG00000230456 ENSG00000234078 ENSG00000204580 ENSG00000223680	ENSMUSG00000003534
UniProt	Q08345	Q03146
RefSeq (мРНК)	NM_001202521 NM_001202522 NM_001202523 NM_001297652 NM_001297653 NM_001297654 NM_001954 NM_013993 NM_013994	NM_001198831 NM_001198833 NM_007584 NM_172962
RefSeq (білок)	NP_001189450 NP_001189451 NP_001189452 NP_001284581 NP_001284582 NP_001284583 NP_001945 NP_054699 NP_054700 NP_001284583.1 NP_054699.2	NP_001185760 NP_001185762 NP_031610 NP_766550
Локус (UCSC)	Хр. 6: 30.88 – 30.9 Mb	Хр. 17: 35.99 – 36.02 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDR1 (англ. Discoidin domain receptor tyrosine kinase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 913 амінокислот, а молекулярна маса — 101 128^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGPEALSSLL		LLLLVASGDA		DMKGHFDPAK		CRYALGMQDR		TIPDSDISAS
SSWSDSTAAR		HSRLESSDGD		GAWCPAGSVF		PKEEEYLQVD		LQRLHLVALV
GTQGRHAGGL		GKEFSRSYRL		RYSRDGRRWM		GWKDRWGQEV		ISGNEDPEGV
VLKDLGPPMV		ARLVRFYPRA		DRVMSVCLRV		ELYGCLWRDG		LLSYTAPVGQ
TMYLSEAVYL		NDSTYDGHTV		GGLQYGGLGQ		LADGVVGLDD		FRKSQELRVW
PGYDYVGWSN		HSFSSGYVEM		EFEFDRLRAF		QAMQVHCNNM		HTLGARLPGG
VECRFRRGPA		MAWEGEPMRH		NLGGNLGDPR		ARAVSVPLGG		RVARFLQCRF
LFAGPWLLFS		EISFISDVVN		NSSPALGGTF		PPAPWWPPGP		PPTNFSSLEL
EPRGQQPVAK		AEGSPTAILI		GCLVAIILLL		LLIIALMLWR		LHWRRLLSKA
ERRVLEEELT		VHLSVPGDTI		LINNRPGPRE		PPPYQEPRPR		GNPPHSAPCV
PNGSALLLSN		PAYRLLLATY		ARPPRGPGPP		TPAWAKPTNT		QAYSGDYMEP
EKPGAPLLPP		PPQNSVPHYA		EADIVTLQGV		TGGNTYAVPA		LPPGAVGDGP
PRVDFPRSRL		RFKEKLGEGQ		FGEVHLCEVD		SPQDLVSLDF		PLNVRKGHPL
LVAVKILRPD		ATKNARNDFL		KEVKIMSRLK		DPNIIRLLGV		CVQDDPLCMI
TDYMENGDLN		QFLSAHQLED		KAAEGAPGDG		QAAQGPTISY		PMLLHVAAQI
ASGMRYLATL		NFVHRDLATR		NCLVGENFTI		KIADFGMSRN		LYAGDYYRVQ
GRAVLPIRWM		AWECILMGKF		TTASDVWAFG		VTLWEVLMLC		RAQPFGQLTD
EQVIENAGEF		FRDQGRQVYL		SRPPACPQGL		YELMLRCWSR		ESEQRPPFSQ
LHRFLAEDAL		NTV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Johnson J.D., Edman J.C., Rutter W.J. (1993). A receptor tyrosine kinase found in breast carcinoma cells has an extracellular discoidin I-like domain. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5677—5681. PMID 8390675 DOI:10.1073/pnas.90.12.5677
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Weiner T.M., Liu E.T., Craven R.J., Cance W.G. (1994). Expression of growth factor receptors, the focal adhesion kinase, and other tyrosine kinases in human soft tissue tumors. Ann. Surg. Oncol. 1: 18—27. PMID 7834423 DOI:10.1007/BF02303537
• Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen. Mol. Cell. 1: 13—23. PMID 9659899 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
• Hou G., Vogel W.F., Bendeck M.P. (2002). Tyrosine kinase activity of discoidin domain receptor 1 is necessary for smooth muscle cell migration and matrix metalloproteinase expression. Circ. Res. 90: 1147—1149. PMID 12065315 DOI:10.1161/01.RES.0000022166.74073.F8
• Huang Y., Arora P., McCulloch C.A., Vogel W.F. (2009). The collagen receptor DDR1 regulates cell spreading and motility by associating with myosin IIA. J. Cell Sci. 122: 1637—1646. PMID 19401332 DOI:10.1242/jcs.046219

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2730 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.
4. UniProt, Q08345 (англ.) . Архів оригіналу за 28 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 6

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»