MUSCLE

MUltiple Sequence Comparison by Log-Expectation
ТипМножинне вирівнювання послідовностей
АвторРоберт Едгар
Розробникdrive5
Перший випуск2004; 20 років тому (2004)
Стабільний випуск3.8.31 (18 серпня 2016; 8 років тому (2016-08-18))
ПлатформаIA-32, x86-64
Операційна системаLinux, macOS, Windows
Мова програмуванняC++
Доступні мовианглійська
ЛіцензіяСуспільне надбання
Репозиторійwww.drive5.com/muscle/downloads.htm
Вебсайтwww.drive5.com/muscle

MUSCLE (англ. MUltiple Sequence Comparison by Log-Expectation) — програмний засіб для множинного вирівнювання амінокислотних і нуклеотидних послідовностей. Ця програма поширюється як суспільне надбання. Метод був описаний Робертом Едгаром у двох роботах у 2004 році. У першій статті, опублікованій в Nucleic Acids Research, був представлений алгоритм вирівнювання послідовностей[1]. У другій статті, опублікованій в BMC Bioinformatics, представлено більше технічних деталей[2].

Посилання

[ред. | ред. код]
  1. ↑ Edgar RC (2004). MUSCLE: multiple sequence alignment with high accuracy and high throughput. Nucleic Acids Research. 32 (5): 1792—97. doi:10.1093/nar/gkh340. PMC 390337. PMID 15034147.
  2. ↑ Edgar RC (2004). MUSCLE: a multiple sequence alignment method with reduced time and space complexity. BMC Bioinformatics. 5 (1): 113. doi:10.1186/1471-2105-5-113. PMC 517706. PMID 15318951.{{cite journal}}: Обслуговування CS1: Сторінки із непозначеним DOI з безкоштовним доступом (посилання)


Програмне забезпечення Це незавершена стаття про програмне забезпечення.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.