TNFRSF11A

TNFRSF11A
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1LB5
Ідентифікатори
Символи	TNFRSF11A, tumor necrosis factor receptor superfamily, member 11a, NFKB activator, CD265, FEO, LOH18CR1, ODFR, OFE, OPTB7, OSTS, PDB2, RANK, TRANCER, tumor necrosis factor receptor superfamily member 11a, TNF receptor superfamily member 11a, TRANCE-R
Зовнішні ІД	OMIM: 603499 MGI: 1314891 HomoloGene: 2848 GeneCards: TNFRSF11A
Пов'язані генетичні захворювання
Polyostotic osteolytic dysplasia, hereditary expansile, autosomal recessive osteopetrosis 7[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor-activated receptor activity • transmembrane signaling receptor activity • GO:0019974 cytokine binding • signaling receptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • integral component of plasma membrane • cell surface • external side of plasma membrane • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • regulation of apoptotic process • response to cytokine • response to interleukin-1 • адаптивна імунна відповідь • осифікація • monocyte chemotaxis • circadian temperature homeostasis • positive regulation of JUN kinase activity • osteoclast differentiation • cell-cell signaling • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • mammary gland alveolus development • multicellular organism development • response to tumor necrosis factor • response to lipopolysaccharide • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of fever generation by positive regulation of prostaglandin secretion • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade via TNFSF11-mediated signaling • positive regulation of cell population proliferation • apoptotic signaling pathway • response to radiation • TNFSF11-mediated signaling pathway • inflammatory response • lymph node development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • positive regulation of bone resorption • multinuclear osteoclast differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8792	21934
Ensembl	ENSG00000141655	ENSMUSG00000026321
UniProt	Q9Y6Q6	O35305
RefSeq (мРНК)	NM_001270949 NM_001270950 NM_001270951 NM_001278268 NM_003839	NM_009399
RefSeq (білок)	NP_001257878 NP_001257879 NP_001257880 NP_001265197 NP_003830	NP_033425
Локус (UCSC)	Хр. 18: 62.33 – 62.39 Mb	Хр. 1: 105.71 – 105.78 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNFRSF11A (англ. TNF receptor superfamily member 11a) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 616 амінокислот, а молекулярна маса — 66 034^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPRARRRRP		LFALLLLCAL		LARLQVALQI		APPCTSEKHY		EHLGRCCNKC
EPGKYMSSKC		TTTSDSVCLP		CGPDEYLDSW		NEEDKCLLHK		VCDTGKALVA
VVAGNSTTPR		RCACTAGYHW		SQDCECCRRN		TECAPGLGAQ		HPLQLNKDTV
CKPCLAGYFS		DAFSSTDKCR		PWTNCTFLGK		RVEHHGTEKS		DAVCSSSLPA
RKPPNEPHVY		LPGLIILLLF		ASVALVAAII		FGVCYRKKGK		ALTANLWHWI
NEACGRLSGD		KESSGDSCVS		THTANFGQQG		ACEGVLLLTL		EEKTFPEDMC
YPDQGGVCQG		TCVGGGPYAQ		GEDARMLSLV		SKTEIEEDSF		RQMPTEDEYM
DRPSQPTDQL		LFLTEPGSKS		TPPFSEPLEV		GENDSLSQCF		TGTQSTVGSE
SCNCTEPLCR		TDWTPMSSEN		YLQKEVDSGH		CPHWAASPSP		NWADVCTGCR
NPPGEDCEPL		VGSPKRGPLP		QCAYGMGLPP		EEEASRTEAR		DQPEDGADGR
LPSSARAGAG		SGSSPGGQSP		ASGNVTGNSN		STFISSGQVM		NFKGDIIVVY
VSQTSQEGAA		AAAEPMGRPV		QEETLARRDS		FAGNGPRFPD		PCGGPEGLRE
PEKASRPVQE		QGGAKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном натрію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

• Sirinian C., Papanastasiou A.D., Zarkadis I.K., Kalofonos H.P. (2013). Alternative splicing generates a truncated isoform of human TNFRSF11A (RANK) with an altered capacity to activate NF-kappaB. Gene. 525: 124—129. PMID 23664977 DOI:10.1016/j.gene.2013.04.075

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з TNFRSF11A переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11908 (англ.) . Архів оригіналу за 31 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.
5. UniProt, Q9Y6Q6 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 18

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»