Fíu de Ricardo Pérez de Cuéllar y de Rosa de la Guerra Cevallos, estudió nel Colegio San Agustín de Lima. Una vegada concluyida la secundaria, ingresó a la Pontificia Universidá Católica de Perú pa siguir estudios de Derechu, optando'l títulu profesional na mentada carrera.
Casáu en primeres nupcias cola ciudadana francesa Yvette Roberts (finada en Lisboa, 2013), de que'l so matrimoniu tuvieron dos fíos, Francisco (nacíu en 1947, en París) y Águeda Cristina (nacida en 1955, en Londres). Tuvo casáu en segundes nupcias cola ciudadana trujillana Marcela Temple Seminariu (finada en Bruxeles, 2013).
Trabayó nel ministeriu de Rellaciones Esteriores peruanu dende 1940 y nel cuerpu diplomáticu en 1944.
Participó en misiones nes embaxaes del Reinu Xuníu, Bolivia y Brasil, tornó en 1961 al ministeriu, onde permaneció hasta 1969, sacante dos años nos que foi embaxador en Suiza (1964-1966).
En 1969, foi nomáu embaxador de Perú na Unión de Repúbliques Socialistes Soviétiques (1969-1971) per primer vegada, nel gobiernu de Juan Velasco, rompiendo'l marcu estrechu de la diplomacia peruana hasta entós.
En 1991, axustó'l fin de les hostilidaes na guerra del Golfu Pérsicu. Llogró la lliberación de los rehenes occidentales secuestraos pol grupu islámicu Hezbolá n'El Líbanu, y la paz ente'l gobiernu y la guerrilla d'El Salvador.
En 2002, asumió'l cargu d'Embaxador de Perú en Francia y ante la Unesco. El 22 de xunetu de 2004, Javier Pérez de Cuéllar presenta l'arrenunciu a esti cargu, la que foi aceptada pa rexir dende'l primeru de payares de 2004, pero depués retardada hasta'l 31 d'avientu de 2004.
A solicitú de distintos grupos políticos peruanos, aportó a ser candidatu a la presidencia de la República del so país en 1995. Con esti fin, en 1994, fundó'l partíu políticu Unión pol Perú. Nes eleiciones algamó la segunda mayor votación, pero foi reelixíu en primer vuelta l'entós Presidente Alberto Fujimori al llograr el 64% de votos válidos (la llei eleutoral peruana otorga'l trunfu en primer vuelta al candidatu que llogre más del 50% de votos válidos).
Depués de les eleiciones, Pérez de Cuéllar instalar en París.
Pérez de Cuéllar llegó a Lima'l 24 de xunetu de 2001 y formó con Paniagua el nuevu gabinete de ministros, nel cual alcordóse que l'embaxador tamién asumiría'l cargu de Ministru de Rellaciones Esteriores.
Como canciller, encargar de la reinserción de Perú na comunidá internacional ya impulsó la Carta Democrática nel Cume Interamericana de Quebec. De la mesma manera, retomáronse les rellaciones cola Corte Interamericana de Derechos Humanos.
Trabayó tamién como profesor de derechu Internacional na Academia Diplomática de Perú y como Profesor de Rellaciones Internacionales na Academia de Guerra Aérea de Perú.
Nel añu 2000 y por cuenta del so ochentenu aniversariu, recibió na Universidá de Lima un significativu homenaxe onde dictó una charra maxistral sobre rellaciones internacionales. En dicha ocasión, espunxéronse toles sos condecoraciones en vitrines asitiaes nuna sala especial.
El 22 de xunetu de 2005, sufre un infartu y ye tratáu na unidá de cuidos intensivos nun centru hospitalariu en París, onde-y dieron d'alta'l 30 de xunetu del citáu añu.
Ostenta'l cargu permanente de Embaxador de Perú en Misión Especial del Estáu Peruanu.
El 19 de xineru de 2010, mientres les celebraciones pol so noventenu aniversariu, les Naciones Xuníes, el Programa de les Naciones Xuníes pal Desenvolvimientu y el Gobiernu de Perú honrar con una estampilla, llibru d'alcordances de personalidaes mundiales, según una medaya conmemorando la ocasión. Coles mesmes, la nueva sede de les Naciones Xuníes en Lima foi denomada "Complexu Javier Pérez de Cuéllar".[22] Al actu d'inauguración del edificiu asistieron 800 invitaos, presidíos pol Presidente Alan García, con discursos per parte del Canciller de la República y otros altos funcionarios tantu de les Naciones Xuníes como del Ministeriu de Rellaciones Esteriores.
El 9 d'agostu de 2010, n'ocasión d'una ceremonia habida nel Palaciu de Torre Tagle, Javier Pérez de Cuéllar fixo donación a la so Alma Máter de toles condecoraciones recibíes de decenes de países por que sían exhibíes nel Centru Cultural Inca Garcilaso, dependencia de la cancillería peruana. En dicha ocasión mentó que "Nun ye un presente. Ye una retribución. Toi devolviendo lo aprendío en tantos años de servicios al Ministeriu de Rellaciones Esteriores"[23][24][25][26]
Avera del numberosu intercambiu d'opiniones ente políticos y la prensa de Perú y de Chile, sobre una eventual devolución del Monitor Huáscar a Perú, que nun forma parte de l'axenda billateral pero surde arriendes de la entruga d'un periodista al Ministru de Defensa chilenu Jaime Ravinet, n'ocasión de la so visita a Perú'l 16 d'agostu de 2009, Javier Pérez de Cuéllar cuntó que "como peruanu qué tanto puedo deseyar que devuelvan el Huáscar al nuesu país".[27]
El 6 de setiembre de 2010, Javier Pérez de Cuéllar informa, por aciu comunicáu públicu, que persones inescrupulosas tomaron el so nome con cuenta de pidir ayuda económica en beneficiu del tratamientu médicu de persones enfermes.[28] Ante esta situación l'embaxador sollertó a la comunidá internacional, dende'l so sitiu web oficial, sobre esta modalidá d'estafa.[29]