ACSF3

ACSF3
Identifikatori
AliasiACSF3
Vanjski ID-jeviOMIM: 614245 MGI: 2182591 HomoloGene: 14958 GeneCards: ACSF3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 16 (čovjek)
Hrom.Hromosom 16 (čovjek)[1]
Hromosom 16 (čovjek)
Genomska lokacija za ACSF3
Genomska lokacija za ACSF3
Bend16q24.3Početak89,088,375 bp[1]
Kraj89,164,121 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 8 (miš)
Hrom.Hromosom 8 (miš)[2]
Hromosom 8 (miš)
Genomska lokacija za ACSF3
Genomska lokacija za ACSF3
Bend8|8 E1Početak122,775,486 bp[2]
Kraj122,817,880 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija• nucleotide binding
• malonyl-CoA synthetase activity
• ligase activity
• ATP binding
• catalytic activity
• acid-thiol ligase activity
• very long-chain fatty acid-CoA ligase activity
Ćelijska komponenta• mitochondrial matrix
• mitohondrija
Biološki proces• malonate catabolic process
• metabolizam
• fatty acid biosynthetic process
• long-chain fatty-acyl-CoA biosynthetic process
• fatty acid metabolic process
• lipid metabolism
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez

197322

257633

Ensembl

ENSG00000176715

ENSMUSG00000015016

UniProt

Q4G176

Q3URE1

RefSeq (mRNK)

NM_001127214
NM_001243279
NM_001284316
NM_174917

NM_144932

RefSeq (bjelančevina)

NP_001120686
NP_001230208
NP_001271245
NP_777577

NP_659181

Lokacija (UCSC)Chr 16: 89.09 – 89.16 MbChr 8: 122.78 – 122.82 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Član 3 porodice acil-CoA sintetaze jest enzim koji je kod ljudi kodiran genom ACSF3.[5]

Struktura

Dužina polipeptidnog lanca je 576 aminokiselina, a molekulska težina 64.130 Da.[6]

Simboli

C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin

1020304050
MLPHVVLTFRRLGCALASCRLAPARHRGSGLLHTAPVARSDRSAPVFTRA
LAFGDRIALVDQHGRHTYRELYSRSLRLSQEICRLCGCVGGDLREERVSF
LCANDASYVVAQWASWMSGGVAVPLYRKHPAAQLEYVICDSQSSVVLASQ
EYLELLSPVVRKLGVPLLPLTPAIYTGAVEEPAEVPVPEQGWRNKGAMII
YTSGTTGRPKGVLSTHQNIRAVVTGLVHKWAWTKDDVILHVLPLHHVHGV
VNALLCPLWVGATCVMMPEFSPQQVWEKFLSSETPRINVFMAVPTIYTKL
MEYYDRHFTQPHAQDFLRAVCEEKIRLMVSGSAALPLPVLEKWKNITGHT
LLERYGMTEIGMALSGPLTTAVRLPGSVGTPLPGVQVRIVSENPQREACS
YTIHAEGDERGTKVTPGFEEKEGELLVRGPSVFREYWNKPEETKSAFTLD
GWFKTGDTVVFKDGQYWIRGRTSVDIIKTGGYKVSALEVEWHLLAHPSIT
DVAVIGVPDMTWGQRVTAVVTLREGHSLSHRELKEWARNVLAPYAVPSEL
VLVEEIPRNQMGKIDKKALIRHFHPS

Gen ACSF3 nalazi se na hromosomu 16, a njegova specifična lokacija je 16q24.3. Gen sadrži 17 egzona.[5] ASCL4 kodira protein od 64,1 kDa koji se sastoji od 576 aminokiselina; podaci dobijeni masenom spektrometrijom potvrđuju kodiranje 20 peptida.[7][8]

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira člana porodice acetil-CoA sintetaza, enzima koji aktiviraju masne kiseline katalizirajući stvaranje tioesterske veze između masnih kiselina i koenzima A. Kodirani protein je lokaliziran u mitohondrijama, ima visoku specifičnost za malonat i metilmalonat i posjeduje aktivnost malonil-CoA sintetaze.[5]

Klinički značaj

[uredi | uredi izvor]

Pokazalo se da mutacije ovog gena uzrokuju kombinirani malonski i metilmalonski poremećaj zvani acidurija.[9] Kombinirana malonska i metilmalonska acidurija (CMAMMA) je stanje koje karakteriziraju visoki nivoi malonske i metilmalonske kiseline, jer nedostaci u ovom genu uzrokuju da se ti metaboliti ne razgrađuju. Bolest se obično dijagnosticira genetičkim ispitivanjem ili višim nivoima metilmalonske od malonske kiseline u mokraći, iako su obje povišene. Poremećaj obično ima simptome u ranom djetinjstvu, prvo započinjući visokim nivoom kiseline u krvi (ketoacidoza). Poremećaj se može ispoljavai kao nehotično zatezanje mišića (distonija), slab tonus mišića (hipotonija), zastoj u razvoju, nemogućnost rasta i debljanja očekivanom brzinom (neuspjeh u napredovanju), nizak šećer u krvi (hipoglikemija) i koma. Neka pogođena djeca mogu čak imati i mikrocefaliju. Drugi ljudi sa CMAMMA ne razvijaju znakove i simptome do odrasle dobi. Te osobe obično imaju neurološke probleme, kao što su napadi, gubitak pamćenja, pad sposobnosti razmišljanja ili psihijatrijske bolesti.[5]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000176715 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000015016 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b c d "Entrez Gene: Acyl-CoA synthetase family member 3". Pristupljeno 30. 12. 2011.
  6. ^ "UniProt, Q4G176". Pristupljeno 30. 6. 2021.
  7. ^ ]Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J, Duan H, Uhlen M, Yates JR, Apweiler R, Ge J, Hermjakob H, Ping P (Oct 2013). "Integration of cardiac proteome biology and medicine by a specialized knowledgebase". Circulation Research. 113 (9): 1043–53. doi:10.1161/CIRCRESAHA.113.301151. PMC 4076475. PMID 23965338.
  8. ^ "Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial". Cardiac Organellar Protein Atlas Knowledgebase (COPaKB).[trajno mrtav link]
  9. ^ Alfares A, Nunez LD, Al-Thihli K, Mitchell J, Melançon S, Anastasio N, Ha KC, Majewski J, Rosenblatt DS, Braverman N (septembar 2011). "Combined malonic and methylmalonic aciduria: exome sequencing reveals mutations in the ACSF3 gene in patients with a non-classic phenotype". J. Med. Genet. 48 (9): 602–5. doi:10.1136/jmedgenet-2011-100230. PMID 21785126.

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]