HLA-DRA

HLA-DRA
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1A6A, 1AQD, 1BX2, 1D5M, 1D5X, 1D5Z, 1D6E, 1DLH, 1FV1, 1FYT, 1H15, 1HXY, 1J8H, 1JWM, 1JWS, 1JWU, 1KG0, 1KLG, 1KLU, 1LO5, 1PYW, 1R5I, 1SEB, 1SJE, 1SJH, 1T5W, 1T5X, 1YMM, 1ZGL, 2FSE, 2G9H, 2IAM, 2IAN, 2ICW, 2IPK, 2OJE, 2Q6W, 2WBJ, 2XN9, 3C5J, 3L6F, 3O6F, 3PDO, 3PGC, 3PGD, 3QXA, 3QXD, 3S4S, 3S5L, 3T0E, 4AEN, 4AH2, 4E41, 4FQX, 4GBX, 4H1L, 4C56, 4H25, 4H26, 4I5B, 4IS6, 4MCY, 4MCZ, 4MD0, 4MD4, 4MD5, 4MDI, 4MDJ, 4OV5, 4Y19, 4Y1A, 4X5X, 4X5W

Identifikatori
AliasiHLA-DRA
Vanjski ID-jeviOMIM: 142860 MGI: 95900 HomoloGene: 7751 GeneCards: HLA-DRA
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za HLA-DRA
Genomska lokacija za HLA-DRA
Bend6p21.32Početak32,439,878 bp[1]
Kraj32,445,046 bp[1]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija peptide antigen binding
MHC class II receptor activity
MHC class II protein complex binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta integral component of membrane
endocytic vesicle membrane
clathrin-coated endocytic vesicle membrane
endozom
Golđijev aparat
trans-Golgi network membrane
endoplasmic reticulum membrane
membrana
late endosome membrane
Golđijeva membrana
ćelijska membrana
transport vesicle membrane
integral component of plasma membrane
cell surface
lysosomal membrane
Endoplazmatski retikulum
ER to Golgi transport vesicle membrane
Lizozom
integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane
endosome membrane
Egzosom
MHC class II protein complex
Biološki proces antigen processing and presentation
antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II
kognitivna funkcija
interferon-gamma-mediated signaling pathway
immune system process
T cell costimulation
antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II
GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 Imuni odgovor
peptide antigen assembly with MHC class II protein complex
GO:0022415 viral process
T cell receptor signaling pathway
adaptive immune response
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
ENSG00000206308
ENSG00000228987
ENSG00000230726
ENSG00000204287
ENSG00000227993
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_019111

NM_010381

RefSeq (bjelančevina)

NP_061984

NP_034511

Lokacija (UCSC)Chr 6: 32.44 – 32.45 Mbn/a
PubMed pretraga[2][3]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

DR alfa-lanac HLA klase II antigena histokompatibilnosti jest protein koji je kod ljudi kodiran genom HLA-DRA.[4] HLA-DRA kodira alfa podjedinicu HLA-DR. Za razliku od alfa lanaca drugih ljudskih molekula kompleksne klase II MHC, alfa podjedinica je praktično nepromjenjiva. Međutim, može se upariti sa, u bilo koje osobe, beta-lancem iz tri različita DR beta lokusa, DRB1 i dva bilo koja od DRB3, aleli DRB4 ili DRB5. Stoga postoji potencijal da bilo koja osoba može formirati četiri različite HLA-DR izoforme (po dva alela DRB1 i DRB3, DRB4 ili DRB5).

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 254 aminokiseline, а molekulska težina Da. 28 607[5]

1020304050
MAISGVPVLGFFIIAVLMSAQESWAIKEEHVIIQAEFYLNPDQSGEFMFD
FDGDEIFHVDMAKKETVWRLEEFGRFASFEAQGALANIAVDKANLEIMTK
RSNYTPITNVPPEVTVLTNSPVELREPNVLICFIDKFTPPVVNVTWLRNG
KPVTTGVSETVFLPREDHLFRKFHYLPFLPSTEDVYDCRVEHWGLDEPLL
KHWEFDAPSPLPETTENVVCALGLTVGLVGIIIGTIFIIKGVRKSNAAER
RGPL

Genska struktura i polimorfizmi

[uredi | uredi izvor]

Alfa-lanac je težak približno 33-35 kDa, a njegov gen sadrži pet egzona. Egzon 1 kodira vodeći peptid, egzoni 2 i 3 kodiraju dva vanćelijska domena, a egzon 4 kodira transmembranski domen i citoplazmatski rep. DRA nema polimorfizme u dijelu koji se veže za peptide i djeluje kao jedini alfa-lanac za DRB1, DRB3, DRB4 i DRB5.[4]

U ljudskoj populaciji postoje dva različita lanca HLA-DRA, kodirana s tri različita alela DRA:

DRA*01: 01
DRA*01: 02: 01
DRA*01: 02: 02

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Polipeptidna podjedinica kodirana ovim genom pripada alfa-lancu HLA klasi II paraloga. Protein klase II je heterodimer koji se sastoji od alfa (DRα) i beta-lanca (DRβ), oba usidrena u membrani. Ima centralnu ulogu u imunskom sistemu predstavljajući peptide izvedene iz vanćelijskih proteina. Molekule klase II su eksprimirane u ćelijama koje prezentiraju antigene (APC: B limfociti, dendritske ćelije, makrofagi).[4]

Također pogledajte

[uredi | uredi izvor]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c ENSG00000228987, ENSG00000230726, ENSG00000204287, ENSG00000227993, ENSG00000226260, ENSG00000234794, ENSG00000277263 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000206308, ENSG00000228987, ENSG00000230726, ENSG00000204287, ENSG00000227993, ENSG00000226260, ENSG00000234794, ENSG00000277263 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  3. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ a b c "Entrez Gene: HLA-DRA major histocompatibility complex, class II, DR alpha".
  5. ^ "UniProt, P01903" (jezik: engleski). Pristupljeno 3. 10. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]