TAC4
Tahkinin-4 je protein koji je kod ljudi kodiran genom TAC4.[5][6][7]
Ovaj gen je član porodice tahikininskih gena koji kodiraju neurotransmitere. Proteini tahikinina se cijepaju u male, lučene peptide koji aktiviraju članove porodice receptorskih proteina. Proizvodi ovog gena preferencijalno aktiviraju tahikininski receptor 1, a smatra se da reguliraju periferne endokrine i parakrine funkcije, uključujući krvni pritisak, imunski sistem i sekrsciju endokrinih žlijezda. Proizvodima ovog gena nedostaje dibazno mjesto cijepanja koje se nalazi u drugim tahikinininskim proteinima. Prema tome, prirodu proizvoda cijepanja koji se generiraju in vivo tek treba utvrditi. Za ovaj gen pronađeno je više varijanti transkripta koji kodiraju različite izoforme.[7]
Dužina polipeptidnog lanca je 113 aminokiselina, a molekulska težina 12.305.[8].
Funkcija gena
[uredi | uredi izvor]Analizom vezanje+a i funkcija, Kurtz et al. (2002) utvrdili su da su ljudski i mišji HK1 peptidi gotovo identični supstanci P u svom ukupnom profilu aktivnosti na tri neurokininska receptora, sa najjačim afinitetom za NK1 receptor i mnogo nižim afinitetom za NK2 i NK3 receptor.
Page et al. (2003) izvijestili su o četiri ljudska tahikinina, endokinin A, B, C i D (EKA-D), kodiranih jednim genom TAC4, koji generira čtii iRNK (alfa, beta, gama i delta). Ekspresija TAC4 gena otkrivena je prvenstveno u nadbubrežnoj žlijezdi i u posteljici, gdje su, kao u slučaju neurokinina B, otkrivene značajne količine imunoreaktivnosti slične EKB. EKA/B je pokazao identične hemodinamske učinke na supstancu P (SP) kod paova, uzrokujući kratkotrajne padove srednjeg arterijskog krvnog pritiska, povezane s tahikardijom, mezenternom vazokonstrikcijom i značajnom vazodilatacijom zadnjeg dijela. Dakle, EKA / B bi mogli biti endokrini/parakrini agonisti na perifernim receptorima SP, a možda postoje i neidentificirani receptori za EKC/D.
Kurtz et al. (2002) utvrdili suda gen TAC4 sadrži dva egzona, a da ih gen Tac4 miša ima tri.[9][10][11]
Aminokiselinska sekvenca
[uredi | uredi izvor]- Simboli
C: Cistein
D: Asparaginska kiselina
E: Glutaminska kiselina
F: Fenilalanin
G: Glicin
H: Histidin
I: Izoleucin
K: Lizin
L: Leucin
M: Metionin
N: Asparagin
P: Prolin
Q: Glutamin
R: Arginin
S: Serin
T: Treonin
V: Valin
W: Triptofan
Y: Tirozin
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLPCLALLLL | MELSVCTVAG | DGGEEQTLST | EAETWVIVAL | EEGAGPSIQL | ||||
| QLQEVKTGKA | SQFFGLMGKR | VGGRPLIQPR | RKKAYQLEHT | FQGLLGKRSL | ||||
| FTEGREDEAQ | GSE |
Kloniranje i ekspresija
[uredi | uredi izvor]Pretragom EST baze podataka koristeći mišji peptid Hk1 kao upit, nakon čega slijedi PCR amplifikacija pomoću biblioteke cDNK hipotalamusa i timusa, Kurtz et al. (2002) klonirali su TAC4, koji su nazvali PPTC. Za razliku od mišjeg Tac4 prepropeptida, kod kojeg predviđeni aktivni Hk1 peptid stoji uz bočnu bazu mjesta cijepanja, izvedeni ljudskii 68-aminokiselinski TAP4 pretpeptid ima dvs potencijalna monobazna mjesta cijepanja na N-terminalnom kraju HK1 peptida. Kao rezultat, TAC4 ima potencijal da generira 11-aminokiselinski HK1 peptid, što je ekvivalentno Hk1 kod miša, ili 8-aminokiselinsku varijantu HK1 peptida. Prepepeptidi TAC4 ljudi i miševa imaju ukupno 57% homologije, sa najvećom konzervacijom pretpostavljenog signalnog peptida i predviđenog HK1 peptida. RT-PCR analiza otkrila je snažnu ekspresiju TAC4 u srcu, skeletnim mišićima, koži i štitnjači i slabiju ekspresiju u bubrezima, jetri, plućima, želucu, testisu, posteljici, prostati i fetusnoj jetri. Nije otkrivena ekspresija u cijelom mozgu, ali TAC4 je otkriven u hipotalamusu. U tkivima miša pronađen je nešto drugačiji obrazac ekspresije, uključujući ekspresiju u cijelom mozgu.
Reference
[uredi | uredi izvor]- ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000176358 - Ensembl, maj 2017
- ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000020872 - Ensembl, maj 2017
- ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^ Zhang Y, Lu L, Furlonger C, Wu GE, Paige CJ (Mar 2001). "Hemokinin is a hematopoietic-specific tachykinin that regulates B lymphopoiesis". Nat Immunol. 1 (5): 392–7. doi:10.1038/80826. PMID 11062498. S2CID 24408728.
- ^ Kurtz MM, Wang R, Clements MK, Cascieri MA, Austin CP, Cunningham BR, Chicchi GG, Liu Q (Oct 2002). "Identification, localization and receptor characterization of novel mammalian substance P-like peptides". Gene. 296 (1–2): 205–12. doi:10.1016/S0378-1119(02)00861-2. PMID 12383518.
- ^ a b "Entrez Gene: TAC4 tachykinin 4 (hemokinin)".
- ^ "UniProt, Q86UU9". Pristupljeno 12. 6. 2021.
- ^ Berger, A., Benveniste, P., Corfe, S. A., Tran, A. H., Barbara, M., Wakeham, A., Mak, T. W., Iscove, N. N., Paige, C. J. Targeted deletion of the tachykinin 4 gene (TAC4-/-) influences the early stages of B lymphocyte development. Blood 116: 3792-3801, 2010. [PubMed]: 20660792
- ^ Kurtz, M. M., Wang, R., Clements, M. K., Cascieri, M. A., Austin, C. P., Cunningham, B. R., Chicchi, G. G., Liu, Q. Identification, localization and receptor characterization of novel mammalian substance P-like peptides. Gene 296: 205-212, 2002. [PubMed]: 12383518
- ^ Page, N. M., Bell, N. J., Gardiner, S. M., Manyonda, I. T., Brayley, K. J., Strange, P. G., Lowry, P. J. Characterization of the endokinins: human tachykinins with cardiovascular activity. Proc. Nat. Acad. Sci. 100: 6245-6250, 2003. [PubMed]: 12716968
Dopunska literatura
[uredi | uredi izvor]- Page NM (2007). "Characterization of the gene structures, precursor processing and pharmacology of the endokinin peptides". Vascul. Pharmacol. 45 (4): 200–8. doi:10.1016/j.vph.2005.08.028. PMID 16931167.
- Page NM (2004). "Hemokinins and endokinins". Cell. Mol. Life Sci. 61 (13): 1652–63. doi:10.1007/s00018-004-4035-x. PMID 15224188. S2CID 31599641.
- Cunningham S, O'Doherty C, Patterson C, et al. (2007). "The neuropeptide genes TAC1, TAC3, TAC4, VIP and PACAP(ADCYAP1), and susceptibility to multiple sclerosis" (PDF). J. Neuroimmunol. 183 (1–2): 208–13. doi:10.1016/j.jneuroim.2006.11.002. PMID 17175032. S2CID 23701000.
- Page NM, Bell NJ, Gardiner SM, et al. (2003). "Characterization of the endokinins: Human tachykinins with cardiovascular activity". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100 (10): 6245–50. doi:10.1073/pnas.0931458100. PMC 156357. PMID 12716968.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073/pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Bellucci F, Carini F, Catalani C, et al. (2002). "Pharmacological profile of the novel mammalian tachykinin, hemokinin 1". Br. J. Pharmacol. 135 (1): 266–74. doi:10.1038/sj.bjp.0704443. PMC 1573107. PMID 11786503.
- Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). "Shotgun sequencing of the human transcriptome with ORF expressed sequence tags". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073/pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.