ARHGAP35

ARHGAP35
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2K85, 3C5H, 3FK2
Ідентифікатори
Символи	ARHGAP35, GRF-1, GRLF1, P190-A, P190A, p190ARhoGAP, p190RhoGAP, Rho GTPase activating protein 35
Зовнішні ІД	OMIM: 605277 MGI: 1929494 HomoloGene: 35136 GeneCards: ARHGAP35
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GTP binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • phospholipid binding • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity • GO:0006184 GTPase activity • nucleotide binding • lipid binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • actin cytoskeleton • клітинне ядро • цитоскелет • cell projection • клітинна мембрана • мембрана • ciliary basal body Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of Rho protein signal transduction • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • neural tube closure • regulation of cell shape • forebrain development • camera-type eye development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of vascular permeability • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • axon guidance • axonal fasciculation • regulation of actin polymerization or depolymerization • positive regulation of neuron projection development • cell migration • central nervous system neuron axonogenesis • mammary gland development • establishment or maintenance of actin cytoskeleton polarity • cellular response to extracellular stimulus • regulation of actin cytoskeleton organization • wound healing, spreading of cells • positive regulation of cilium assembly • regulation of axonogenesis • neuron projection guidance Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2909	232906
Ensembl	ENSG00000160007	ENSMUSG00000058230
UniProt	Q9NRY4	Q91YM2
RefSeq (мРНК)	NM_004491 NM_024342	NM_172739
RefSeq (білок)	NP_004482	NP_766327
Локус (UCSC)	Хр. 19: 46.86 – 47.01 Mb	Хр. 7: 16.23 – 16.35 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGAP35 (англ. Rho GTPase activating protein 35) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 499 амінокислот, а молекулярна маса — 170 514^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMMARKQDVR		IPTYNISVVG		LSGTEKEKGQ		CGIGKSCLCN		RFVRPSADEF
HLDHTSVLST		SDFGGRVVNN		DHFLYWGEVS		RSLEDCVECK		MHIVEQTEFI
DDQTFQPHRS		TALQPYIKRA		AATKLASAEK		LMYFCTDQLG		LEQDFEQKQM
PDGKLLVDGF		LLGIDVSRGM		NRNFDDQLKF		VSNLYNQLAK		TKKPIVVVLT
KCDEGVERYI		RDAHTFALSK		KNLQVVETSA		RSNVNVDLAF		STLVQLIDKS
RGKTKIIPYF		EALKQQSQQI		ATAKDKYEWL		VSRIVKNHNE		NWLSVSRKMQ
ASPEYQDYVY		LEGTQKAKKL		FLQHIHRLKH		EHIERRRKLY		LAALPLAFEA
LIPNLDEIDH		LSCIKAKKLL		ETKPEFLKWF		VVLEETPWDA		TSHIDNMENE
RIPFDLMDTV		PAEQLYEAHL		EKLRNERKRV		EMRRAFKENL		ETSPFITPGK
PWEEARSFIM		NEDFYQWLEE		SVYMDIYGKH		QKQIIDKAKE		EFQELLLEYS
ELFYELELDA		KPSKEKMGVI		QDVLGEEQRF		KALQKLQAER		DALILKHIHF
VYHPTKETCP		SCPACVDAKI		EHLISSRFIR		PSDRNQKNSL		SDPNIDRINL
VILGKDGLAR		ELANEIRALC		TNDDKYVIDG		KMYELSLRPI		EGNVRLPVNS
FQTPTFQPHG		CLCLYNSKES		LSYVVESIEK		SRESTLGRRD		NHLVHLPLTL
ILVNKRGDTS		GETLHSLIQQ		GQQIASKLQC		VFLDPASAGI		GYGRNINEKQ
ISQVLKGLLD		SKRNLNLVSS		TASIKDLADV		DLRIVMCLMC		GDPFSADDIL
FPVLQSQTCK		SSHCGSNNSV		LLELPIGLHK		KRIELSVLSY		HSSFSIRKSR
LVHGYIVFYS		AKRKASLAML		RAFLCEVQDI		IPIQLVALTD		GAVDVLDNDL
SREQLTEGEE		IAQEIDGRFT		SIPCSQPQHK		LEIFHPFFKD		VVEKKNIIEA
THMYDNAAEA		CSTTEEVFNS		PRAGSPLCNS		NLQDSEEDIE		PSYSLFREDT
SLPSLSKDHS		KLSMELEGND		GLSFIMSNFE		SKLNNKVPPP		VKPKPPVHFE
ITKGDLSYLD		QGHRDGQRKS		VSSSPWLPQD		GFDPSDYAEP		MDAVVKPRNE
EENIYSVPHD		STQGKIITIR		NINKAQSNGS		GNGSDSEMDT		SSLERGRKVS
IVSKPVLYRT		RCTRLGRFAS		YRTSFSVGSD		DELGPIRKKE		EDQASQGYKG
DNAVIPYETD		EDPRRRNILR		SLRRNTKKPK		PKPRPSITKA		TWESNYFGVP
LTTVVTPEKP		IPIFIERCIE		YIEATGLSTE		GIYRVSGNKS		EMESLQRQFD
QDHNLDLAEK		DFTVNTVAGA		MKSFFSELPD		PLVPYNMQID		LVEAHKINDR
EQKLHALKEV		LKKFPKENHE		VFKYVISHLN		KVSHNNKVNL		MTSENLSICF
WPTLMRPDFS		TMDALTATRT		YQTIIELFIQ		QCPFFFYNRP		ITEPPGARPS
SPSAVASTVP		FLTSTPVTSQ		PSPPQSPPPT		PQSPMQPLLP		SQLQAEHTL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Levay M., Settleman J., Ligeti E. (2009). Regulation of the substrate preference of p190RhoGAP by protein kinase C-mediated phosphorylation of a phospholipid binding site. Biochemistry. 48: 8615—8623. PMID 19673492 DOI:10.1021/bi900667y
• Bonet R., Ruiz L., Aragon E., Martin-Malpartida P., Macias M.J. (2009). NMR structural studies on human p190-A RhoGAPFF1 revealed that domain phosphorylation by the PDGF-receptor alpha requires its previous unfolding. J. Mol. Biol. 389: 230—237. PMID 19393245 DOI:10.1016/j.jmb.2009.04.035
• LeClerc S., Palaniswami R., Xie B.X., Govindan M.V. (1991). Molecular cloning and characterization of a factor that binds the human glucocorticoid receptor gene and represses its expression. J. Biol. Chem. 266: 17333—17340. PMID 1894621

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4591 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-08 у Wayback Machine.]
4. UniProt, Q9NRY4 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2016. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 19

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»