BHLHA9
Ідентифікатори
Символи
BHLHA9 , BHLHF42, basic helix-loop-helix family member a9, CCSPD
Зовнішні ІД
OMIM : 615416 MGI: 2444198 HomoloGene: 82363 GeneCards: BHLHA9
Пов'язані генетичні захворювання
mesoaxial synostotic syndactyly with phalangeal reduction [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein dimerization activity • protein heterodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 17: 1.27 – 1.27 Mb
Хр. 11: 76.56 – 76.56 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
BHLHA9 (англ. Basic helix-loop-helix family member a9 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 235 амінокислот , а молекулярна маса — 24 132[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLRGAPGLGL TARKGAEDSA EDLGGPCPEP GGDSGVLGAN GASCSRGEAE
EPAGRRRARP VRSKARRMAA NVRERKRILD YNEAFNALRR ALRHDLGGKR
LSKIATLRRA IHRIAALSLV LRASPAPRGP CGHLECHGPA ARGDTGDTGA
SPPPPAGPSL ARPDAARPSV PSAPRCASCP PHAPLARPSA VAEGPGLAQA
SGGSWRRCPG ASSAGPPPWP RGYLRSAPGM GHPRS
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
McLellan A.S., Langlands K., Kealey T. (2002). Exhaustive identification of human class II basic helix-loop-helix proteins by virtual library screening. Mech. Dev . 119 : S285—S291. PMID 14516699 DOI :10.1016/S0925-4773(03)00130-8
Phadke S.R., Kar A., Bhowmik A.D., Dalal A. (2016). Complex Camptosynpolydactyly and Mesoaxial synostotic syndactyly with phalangeal reduction are allelic disorders. Am. J. Med. Genet. A . 170 : 1622—1625. PMID 27041388 DOI :10.1002/ajmg.a.37643
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші