EGR4

EGR4
Ідентифікатори
Символи	EGR4, NGFI-C, NGFIC, PAT133, early growth response 4, Early growth response protein 4, AT133
Зовнішні ІД	OMIM: 128992 MGI: 99252 HomoloGene: 1485 GeneCards: EGR4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • positive regulation of cell population proliferation • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • cellular response to growth factor stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1961	13656
Ensembl	ENSG00000135625	ENSMUSG00000071341
UniProt	Q05215	Q9WUF2
RefSeq (мРНК)	NM_001965	NM_020596
RefSeq (білок)	NP_001956	NP_065621
Локус (UCSC)	Хр. 2: 73.29 – 73.29 Mb	Хр. 6: 85.49 – 85.49 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EGR4 (англ. Early growth response 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 589 амінокислот, а молекулярна маса — 61 623^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVARGVGSP		EPAPPQLYKW		GGCGLGEPGS		ALERRGAAAR		GRCGRARAPR
LPDSFPRGEC		PKPGARAPRS		VRCGEPLPPA		SPPPARPQAQ		RARPRAPHSR
RRAMLHLSEF		SEPDALLVKS		TEGCCAEPSA		ELPRLPARDA		PAATGYPGAG
DFLSWALNSC		GASGDLADSC		FLEGPAPTPP		PGLSYSGSFF		IQAVPEHPHD
PEALFNLMSG		ILGLAPFPGP		EAAASRSPLD		APFPAGSDAL		LPGPPDLYSP
DLGAAPFPEA		FWEASPCAGA		PSQCLYEPQL		SPPDVKPGLR		APPASPALDA
VSAFKGPYAP		WELLSVGAPG		NCGSQGDYQA		APEARFPVIG		TKIEDLLSIS
CPAELPAVPA		NRLYPSGAYD		AFPLAPGDLG		EGAEGLPGLL		TPPSGEGGSS
GDGGEFLAST		QPQLSPLGLR		SAAAADFPKP		LVADIPGSSG		VAAPPVPPPP
PTPFPQAKAR		RKGRRGGKCS		TRCFCPRPHA		KAFACPVESC		VRSFARSDEL
NRHLRIHTGH		KPFQCRICLR		NFSRSDHLTT		HVRTHTGEKP		FACDVCGRRF
ARSDEKKRHS		KVHLKQKARA		EERLKGLGFY		SLGLSFASL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Holst C., Skerka C., Lichter P., Bialonski A., Zipfel P.F. (1993). Genomic organization, chromosomal localization and promoter function of the human zinc-finger gene pAT133. Hum. Mol. Genet. 2: 367—372. PMID 8504297 DOI:10.1093/hmg/2.4.367
• Mueller H.-J., Skerka C., Bialonski A., Zipfel P.F. (1991). Clone pAT133 identifies a gene that encodes another human member of a class of growth factor-induced genes with almost identical zinc-finger domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10079—10083. PMID 1658795 DOI:10.1073/pnas.88.22.10079

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3241 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
4. UniProt, Q05215 (англ.) . Архів оригіналу за 20 грудня 2016. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

• Хромосома 2

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»