FOXD4
Ідентифікатори
Символи
FOXD4 , FKHL9, FOXD4A, FREAC-5, FREAC5, forkhead box D4
Зовнішні ІД
OMIM : 601092 MGI: 1347467 HomoloGene: 83248 GeneCards: FOXD4
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • DNA binding • DNA binding, bending • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 9: 0.12 – 0.12 Mb
Хр. 19: 24.88 – 24.88 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
FOXD4 (англ. Forkhead box D4 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот , а молекулярна маса — 47 309[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MNLPRAERLR STPQRSLRDS DGEDGKIDVL GEEEDEDEEE AASQQFLEQS
LQPGLQVARW GGVALPREHI EGGGGPSDPS EFGTEFRAPP RSAAASEDAR
QPAKPPSSYI ALITMAILQS PHKRLTLSGI CAFISDRFPY YRRKFPAWQN
SIRHNLSLND CFVKIPREPG RPGKGNYWSL DPASQDMFDN GSFLRRRKRF
QRHQPTPGAH LPHPFPLPAA HAALHNPRPG PLLGAPAPPQ PVPGAYPNTG
PGRRPYALLH PHPPRYLLLS APAYAGAPKK AEGADLATPA PFPCCSPHLV
LSLGRRARVW RRHREADASL SALRVSCKGS GERVQGLRRV CPRPRGATAP
CSSDRQACRT ILQQQQRHQE EDCANGCAPT KGAVLGGHLS AASALLRYQA
VAEGSGLTSL AAPLGGEGTS PVFLVSPTPS SLAESAGPS
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Freyaldenhoven B.S., Fried C., Wielckens K. (2002). FOXD4a and FOXD4b, two new winged helix transcription factors, are expressed in human leukemia cell lines. Gene . 294 : 131—140. PMID 12234674 DOI :10.1016/S0378-1119(02)00702-3
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Fan Y., Newman T., Linardopoulou E., Trask B.J. (2002). Gene content and function of the ancestral chromosome fusion site in human chromosome 2q13-2q14.1 and paralogous regions. Genome Res. 12 : 1663—1672. PMID 12421752 DOI :10.1101/gr.338402
Pierrou S., Hellqvist M., Samuelsson L., Enerbaeck S., Carlsson P. (1994). Cloning and characterization of seven human forkhead proteins: binding site specificity and DNA bending. EMBO J . 13 : 5002—5012. PMID 7957066
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші