GTF2E1
|
---|
|
Наявні структури |
---|
PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
Список кодів PDB |
1VD4, 2JTX, 2RNQ, 2RNR, 5IY9, 5IYC, 5IYD, 5IY7, 5IYA, 5IY6, 5IYB, 5IY8
| | |
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| GTF2E1, FE, TF2E1, TFIIE-A, general transcription factor IIE subunit 1 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 189962 MGI: 1921447 HomoloGene: 38062 GeneCards: GTF2E1
|
---|
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 3: 120.74 – 120.78 Mb
| Хр. 16: 37.33 – 37.36 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
GTF2E1 (англ. General transcription factor IIE subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 439 амінокислот, а молекулярна маса — 49 452[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MADPDVLTEV | | PAALKRLAKY | | VIRGFYGIEH | | ALALDILIRN | | SCVKEEDMLE |
LLKFDRKQLR | | SVLNNLKGDK | | FIKCRMRVET | | AADGKTTRHN | | YYFINYRTLV |
NVVKYKLDHM | | RRRIETDERD | | STNRASFKCP | | VCSSTFTDLE | | ANQLFDPMTG |
TFRCTFCHTE | | VEEDESAMPK | | KDARTLLARF | | NEQIEPIYAL | | LRETEDVNLA |
YEILEPEPTE | | IPALKQSKDH | | AATTAGAASL | | AGGHHREAWA | | TKGPSYEDLY |
TQNVVINMDD | | QEDLHRASLE | | GKSAKERPIW | | LRESTVQGAY | | GSEDMKEGGI |
DMDAFQEREE | | GHAGPDDNEE | | VMRALLIHEK | | KTSSAMAGSV | | GAAAPVTAAN |
GSDSESETSE | | SDDDSPPRPA | | AVAVHKREED | | EEEDDEFEEV | | ADDPIVMVAG |
RPFSYSEVSQ | | RPELVAQMTP | | EEKEAYIAMG | | QRMFEDLFE |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, ацетиляція.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у ядрі.
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|