HBP1
|
---|
|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| HBP1, HMG-box transcription factor 1 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 616714 MGI: 894659 HomoloGene: 8171 GeneCards: HBP1
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • nuclear speck
|
---|
Біологічний процес |
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • Wnt signaling pathway • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 7: 107.17 – 107.2 Mb
| Хр. 12: 31.98 – 32 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
HBP1 (англ. HMG-box transcription factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 514 амінокислот, а молекулярна маса — 57 645[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MVWEVKTNQM | | PNAVQKLLLV | | MDKRASGMND | | SLELLQCNEN | | LPSSPGYNSC |
DEHMELDDLP | | ELQAVQSDPT | | QSGMYQLSSD | | VSHQEYPRSS | | WNQNTSDIPE |
TTYRENEVDW | | LTELANIATS | | PQSPLMQCSF | | YNRSSPVHII | | ATSKSLHSYA |
RPPPVSSSSK | | SEPAFPHHHW | | KEETPVRHER | | ANSESESGIF | | CMSSLSDDDD |
LGWCNSWPST | | VWHCFLKGTR | | LCFHKGSNKE | | WQDVEDFARA | | EGCDNEEDLQ |
MGIHKGYGSD | | GLKLLSHEES | | VSFGESVLKL | | TFDPGTVEDG | | LLTVECKLDH |
PFYVKNKGWS | | SFYPSLTVVQ | | HGIPCCEVHI | | GDVCLPPGHP | | DAINFDDSGV |
FDTFKSYDFT | | PMDSSAVYVL | | SSMARQRRAS | | LSCGGPGGQD | | FARSGFSKNC |
GSPGSSQLSS | | NSLYAKAVKN | | HSSGTVSATS | | PNKCKRPMNA | | FMLFAKKYRV |
EYTQMYPGKD | | NRAISVILGD | | RWKKMKNEER | | RMYTLEAKAL | | AEEQKRLNPD |
CWKRKRTNSG | | SQQH |
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|