HOXB2
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| HOXB2, HOX2, HOX2H, Hox-2.8, K8, homeobox B2 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 142967 MGI: 96183 HomoloGene: 37584 GeneCards: HOXB2
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • nuclear speck
|
---|
Біологічний процес |
• multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • кровообіг • transcription, DNA-templated • morphogenesis of an epithelial sheet • anterior/posterior pattern specification • dorsal/ventral pattern formation • rhombomere 3 development • rhombomere 4 development • facial nerve structural organization • embryonic skeletal system morphogenesis • skeletal system morphogenesis • neural nucleus development • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 17: 48.54 – 48.55 Mb
| Хр. 11: 96.24 – 96.24 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
HOXB2 (англ. Homeobox B2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 356 амінокислот, а молекулярна маса — 37 914[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MNFEFEREIG | | FINSQPSLAE | | CLTSFPAVLE | | TFQTSSIKES | | TLIPPPPPFE |
QTFPSLQPGA | | STLQRPRSQK | | RAEDGPALPP | | PPPPPLPAAP | | PAPEFPWMKE |
KKSAKKPSQS | | ATSPSPAASA | | VPASGVGSPA | | DGLGLPEAGG | | GGARRLRTAY |
TNTQLLELEK | | EFHFNKYLCR | | PRRVEIAALL | | DLTERQVKVW | | FQNRRMKHKR |
QTQHREPPDG | | EPACPGALED | | ICDPAEEPAA | | SPGGPSASRA | | AWEACCHPPE |
VVPGALSADP | | RPLAVRLEGA | | GASSPGCALR | | GAGGLEPGPL | | PEDVFSGRQD |
SPFLPDLNFF | | AADSCLQLSG | | GLSPSLQGSL | | DSPVPFSEEE | | LDFFTSTLCA |
IDLQFP |
Кодований геном білок за функціями належить до білків розвитку, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|