HOXC4
|
---|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| HOXC4, HOX3, HOX3E, cp19, homeobox C4 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 142974 MGI: 96195 HomoloGene: 8408 GeneCards: HOXC4
|
---|
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • sequence-specific DNA binding • HMG box domain binding • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро
|
---|
Біологічний процес |
• multicellular organism development • skeletal system development • cartilage development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • embryonic organ morphogenesis • transcription, DNA-templated • anterior/posterior pattern specification • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • embryonic skeletal system morphogenesis
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 12: 54.02 – 54.06 Mb
| Хр. 15: 102.93 – 102.95 Mb
|
---|
PubMed search |
[1]
| [2] |
---|
Вікідані |
|
HOXC4 (англ. Homeobox C4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 264 амінокислот, а молекулярна маса — 29 811[4].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MIMSSYLMDS | | NYIDPKFPPC | | EEYSQNSYIP | | EHSPEYYGRT | | RESGFQHHHQ |
ELYPPPPPRP | | SYPERQYSCT | | SLQGPGNSRG | | HGPAQAGHHH | | PEKSQSLCEP |
APLSGASASP | | SPAPPACSQP | | APDHPSSAAS | | KQPIVYPWMK | | KIHVSTVNPN |
YNGGEPKRSR | | TAYTRQQVLE | | LEKEFHYNRY | | LTRRRRIEIA | | HSLCLSERQI |
KIWFQNRRMK | | WKKDHRLPNT | | KVRSAPPAGA | | APSTLSAATP | | GTSEDHSQSA |
TPPEQQRAED | | ITRL |
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку.
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції.
Білок має сайт для зв'язування з ДНК.
Локалізований у ядрі.
- Simeone A., Pannese M., Acampora D., D'Esposito M., Boncinelli E. (1988). At least three human homeoboxes on chromosome 12 belong to the same transcription unit. Nucleic Acids Res. 16: 5379—5390. PMID 2898768 DOI:10.1093/nar/16.12.5379
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|