IRX4

IRX4
Ідентифікатори
Символи	IRX4, IRXA3, iroquois homeobox 4
Зовнішні ІД	OMIM: 606199 MGI: 1355275 HomoloGene: 9485 GeneCards: IRX4
Пов'язані генетичні захворювання
серцево-судинні захворювання[1]
Онтологія гена Молекулярна функція • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • heart development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • establishment of animal organ orientation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	50805	50916
Ensembl	ENSG00000113430	ENSMUSG00000021604
UniProt	P78413	Q9QY61
RefSeq (мРНК)	NM_016358 NM_001278632 NM_001278633 NM_001278634 NM_001278635	NM_018885
RefSeq (білок)	NP_001265561 NP_001265562 NP_001265563 NP_001265564 NP_057442	NP_061373
Локус (UCSC)	Хр. 5: 1.88 – 1.89 Mb	Хр. 13: 73.41 – 73.42 Mb
PubMed search	[2]	[3]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

IRX4 (англ. Iroquois homeobox 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 519 амінокислот, а молекулярна маса — 54 445^[5].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSYPQFGYPY		SSAPQFLMAT		NSLSTCCESG		GRTLADSGPA		ASAQAPVYCP
VYESRLLATA		RHELNSAAAL		GVYGGPYGGS		QGYGNYVTYG		SEASAFYSLN
SFDSKDGSGS		AHGGLAPAAA		AYYPYEPALG		QYPYDRYGTM		DSGTRRKNAT
RETTSTLKAW		LQEHRKNPYP		TKGEKIMLAI		ITKMTLTQVS		TWFANARRRL
KKENKMTWPP		RNKCADEKRP		YAEGEEEEGG		EEEAREEPLK		SSKNAEPVGK
EEKELELSDL		DDFDPLEAEP		PACELKPPFH		SLDGGLERVP		AAPDGPVKEA
SGALRMSLAA		GGGAALDEDL		ERARSCLRSA		AAGPEPLPGA		EGGPQVCEAK
LGFVPAGASA		GLEAKPRIWS		LAHTATAAAA		AATSLSQTEF		PSCMLKRQGP
AAPAAVSSAP		ATSPSVALPH		SGALDRHQDS		PVTSLRNWVD		GVFHDPILRH
STLNQAWATA		KGALLDPGPL		GRSLGAGANV		LTAPLARAFP		PAVPQDAPAA
GAARELLALP		KAGGKPFCA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

1. Захворювання, генетично пов'язані з IRX4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
2. Human PubMed Reference:.
3. Mouse PubMed Reference:.
4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6129 (англ.) . Процитовано 5 вересня 2017.
5. UniProt, P78413 (англ.) . Архів оригіналу за 3 квітня 2017. Процитовано 5 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 5

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»