KLF11
|
---|
|
|
Ідентифікатори
|
---|
Символи
| KLF11, FKLF, FKLF1, MODY7, TIEG2, Tieg3, Kruppel-like factor 11, Kruppel like factor 11 |
---|
Зовнішні ІД |
OMIM: 603301 MGI: 2653368 HomoloGene: 2668 GeneCards: KLF11
|
---|
|
Пов'язані генетичні захворювання |
---|
maturity-onset diabetes of the young type 7[1] |
Онтологія гена |
---|
Молекулярна функція |
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
|
---|
Клітинна компонента |
• клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма • focal adhesion • ядерні тільця
|
---|
Біологічний процес |
• positive regulation of apoptotic process • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • transcription, DNA-templated • negative regulation of cell population proliferation • GO:0097285 апоптоз • cellular response to peptide • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
|
---|
Джерела:Amigo / QuickGO | |
Шаблон експресії |
---|
|
Більше даних
|
Ортологи |
---|
Види |
Людина |
Миша |
---|
Entrez | |
|
---|
Ensembl |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (мРНК) |
| |
---|
RefSeq (білок) |
| |
---|
Локус (UCSC) |
Хр. 2: 10.04 – 10.05 Mb
| Хр. 12: 24.7 – 24.71 Mb
|
---|
PubMed search |
[2]
| [3] |
---|
Вікідані |
|
KLF11 (англ. Kruppel like factor 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 512 амінокислот, а молекулярна маса — 55 139[5].
Послідовність амінокислот
10 | | 20 | | 30 | | 40 | | 50 |
MHTPDFAGPD | | DARAVDIMDI | | CESILERKRH | | DSERSTCSIL | | EQTDMEAVEA |
LVCMSSWGQR | | SQKGDLLRIR | | PLTPVSDSGD | | VTTTVHMDAA | | TPELPKDFHS |
LSTLCITPPQ | | SPDLVEPSTR | | TPVSPQVTDS | | KACTATDVLQ | | SSAVVARALS |
GGAERGLLGL | | EPVPSSPCRA | | KGTSVIRHTG | | ESPAACFPTI | | QTPDCRLSDS |
REGEEQLLGH | | FETLQDTHLT | | DSLLSTNLVS | | CQPCLHKSGG | | LLLTDKGQQA |
GWPGAVQTCS | | PKNYENDLPR | | KTTPLISVSV | | PAPPVLCQMI | | PVTGQSSMLP |
AFLKPPPQLS | | VGTVRPILAQ | | AAPAPQPVFV | | GPAVPQGAVM | | LVLPQGALPP |
PAPCAANVMA | | AGNTKLLPLA | | PAPVFITSSQ | | NCVPQVDFSR | | RRNYVCSFPG |
CRKTYFKSSH | | LKAHLRTHTG | | EKPFNCSWDG | | CDKKFARSDE | | LSRHRRTHTG |
EKKFVCPVCD | | RRFMRSDHLT | | KHARRHMTTK | | KIPGWQAEVG | | KLNRIASAES |
PGSPLVSMPA | | SA |
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів.
Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм, альтернативний сплайсинг.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК.
Локалізований у ядрі.
|
---|
(1) Основні домени |
---|
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP) | |
---|
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH) | |
---|
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP) | |
---|
(1.4) NF-1 | |
---|
(1.5) RF-X | |
---|
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH) | |
---|
|
|
(2) Цинк-координовані домени ДНК |
---|
(2.1)Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4) | підродина 1 | |
---|
підродина 2 | |
---|
підродина 3 | |
---|
підродина 4 | |
---|
підродина 5 | |
---|
підродина 6 | |
---|
підродина 0 | |
---|
|
---|
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 | |
---|
(2.3) Cys2His2 з доменом цинкових пальців | |
---|
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер | |
---|
(2.5) Цинкові пальці іншого складу | |
---|
(2.6) WRKY | |
---|
|
|
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль |
---|
(3.1) Гомеобокс | |
---|
(3.2) Парний бокс | |
---|
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль | |
---|
(3.4) Фактори теплового шоку | |
---|
(3.5) Триптофановий кластер | |
---|
(3.6) Домен транскрипційний енхансер | |
---|
|
|
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом |
---|
(4.1) RHR | |
---|
(4.2) STAT | |
---|
(4.3) p53 | |
---|
(4.4) MADS | |
---|
(4.6) TATA | |
---|
(4.7) Високомобільна група | |
---|
(4.9) Grainyhead | |
---|
(4.10) Домен холодового шоку | |
---|
(4.11) Runt | |
---|
|
|
(0) Інші фактори транскрипції |
---|
(0.2) HMGI(Y) | |
---|
(0.3) Pocket домен | |
---|
(0.5) AP2/EREBP-подібні | |
---|
(0.6) Інші | |
---|
|
|