KLF4

KLF4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2WBS, 2WBU, 4M9E
Ідентифікатори
Символи	KLF4, EZF, GKLF, Kruppel-like factor 4 (gut), Kruppel like factor 4
Зовнішні ІД	OMIM: 602253 MGI: 1342287 HomoloGene: 3123 GeneCards: KLF4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • beta-catenin binding • phosphatidylinositol 3-kinase regulator activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • zinc ion binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0001158 cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • зв'язування з іоном металу • RNA polymerase II sequence-specific DNA-binding transcription factor recruiting activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • double-stranded DNA binding • promoter-specific chromatin binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription coregulator binding • histone deacetylase binding Клітинна компонента • цитоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • Хроматин • клітинне ядро Біологічний процес • negative regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production • epidermal cell differentiation • cellular response to retinoic acid • negative regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of muscle hyperplasia • negative regulation of smooth muscle cell proliferation • GO:0051247, GO:0051200 positive regulation of protein metabolic process • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • regulation of axon regeneration • cellular response to peptide • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of hemoglobin biosynthetic process • response to retinoic acid • somatic stem cell population maintenance • cellular response to laminar fluid shear stress • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • epidermis morphogenesis • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process • cellular response to growth factor stimulus • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • post-embryonic hemopoiesis • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • response to organic substance • negative regulation of gene expression • negative regulation of response to cytokine stimulus • transcription, DNA-templated • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • stem cell population maintenance • negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • GO:1901313 positive regulation of gene expression • negative regulation of cell migration • regulation of cell population proliferation • post-embryonic camera-type eye development • regulation of phosphatidylinositol 3-kinase activity • positive regulation of telomerase activity • canonical Wnt signaling pathway • negative regulation of ERK1 and ERK2 cascade • регуляція диференціювання клітин • mesodermal cell fate determination • negative regulation of heterotypic cell-cell adhesion • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity • cellular response to cycloheximide • negative regulation of inflammatory response • fat cell differentiation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • cellular response to hydrogen peroxide • negative regulation of leukocyte adhesion to arterial endothelial cell • positive regulation of core promoter binding • cellular response to leukemia inhibitory factor • negative regulation of angiogenesis • pri-miRNA transcription by RNA polymerase II • GO:1990376 negative regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of sprouting angiogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9314	16600
Ensembl	ENSG00000136826	ENSMUSG00000003032
UniProt	O43474	Q60793
RefSeq (мРНК)	NM_001314052 NM_004235	NM_010637
RefSeq (білок)	NP_001300981 NP_004226	NP_034767
Локус (UCSC)	Хр. 9: 107.48 – 107.49 Mb	Хр. 4: 55.53 – 55.53 Mb
PubMed search	[1]	[2]
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

KLF4 (англ. Kruppel like factor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 513 амінокислот, а молекулярна маса — 54 671^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRQPPGESDM		AVSDALLPSF		STFASGPAGR		EKTLRQAGAP		NNRWREELSH
MKRLPPVLPG		RPYDLAAATV		ATDLESGGAG		AACGGSNLAP		LPRRETEEFN
DLLDLDFILS		NSLTHPPESV		AATVSSSASA		SSSSSPSSSG		PASAPSTCSF
TYPIRAGNDP		GVAPGGTGGG		LLYGRESAPP		PTAPFNLADI		NDVSPSGGFV
AELLRPELDP		VYIPPQQPQP		PGGGLMGKFV		LKASLSAPGS		EYGSPSVISV
SKGSPDGSHP		VVVAPYNGGP		PRTCPKIKQE		AVSSCTHLGA		GPPLSNGHRP
AAHDFPLGRQ		LPSRTTPTLG		LEEVLSSRDC		HPALPLPPGF		HPHPGPNYPS
FLPDQMQPQV		PPLHYQGQSR		GFVARAGEPC		VCWPHFGTHG		MMLTPPSSPL
ELMPPGSCMP		EEPKPKRGRR		SWPRKRTATH		TCDYAGCGKT		YTKSSHLKAH
LRTHTGEKPY		HCDWDGCGWK		FARSDELTRH		YRKHTGHRPF		QCQKCDRAFS
RSDHLALHMK		RHF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wei X., Xu H., Kufe D. (2007). Human mucin 1 oncoprotein represses transcription of the p53 tumor suppressor gene. Cancer Res. 67: 1853—1858. PMID 17308127 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-06-3063
• Zhang P., Andrianakos R., Yang Y., Liu C., Lu W. (2010). Kruppel-like factor 4 (Klf4) prevents embryonic stem (ES) cell differentiation by regulating Nanog gene expression. J. Biol. Chem. 285: 9180—9189. PMID 20071344 DOI:10.1074/jbc.M109.077958
• Bjerke G.A., Hyman-Walsh C., Wotton D. (2011). Cooperative transcriptional activation by Klf4, Meis2, and Pbx1. Mol. Cell. Biol. 31: 3723—3733. PMID 21746878 DOI:10.1128/MCB.01456-10

Примітки

1. Human PubMed Reference:.
2. Mouse PubMed Reference:.
3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6348 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 8 вересня 2017.
4. UniProt, O43474 (англ.) . Архів оригіналу за 4 червня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

• Хромосома 9

Портал «Біологія»   Портал «Хімія»