MEOX2
Ідентифікатори
Символи
MEOX2 , GAX, MOX2, mesenchyme homeobox 2
Зовнішні ІД
OMIM : 600535 MGI: 103219 HomoloGene: 4330 GeneCards: MEOX2
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • nuclear speck • клітинне ядро
Біологічний процес
• neuron death • roof of mouth development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • somite specification • кровообіг • transcription, DNA-templated • limb development • multicellular organism development • Ангіогенез • skeletal muscle tissue development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis • transcription by RNA polymerase II • somite development
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 15.61 – 15.69 Mb
Хр. 12: 37.16 – 37.23 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
MEOX2 (англ. Mesenchyme homeobox 2 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 304 амінокислот , а молекулярна маса — 33 594[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MEHPLFGCLR SPHATAQGLH PFSQSSLALH GRSDHMSYPE LSTSSSSCII
AGYPNEEGMF ASQHHRGHHH HHHHHHHHHH QQQQHQALQT NWHLPQMSSP
PSAARHSLCL QPDSGGPPEL GSSPPVLCSN SSSLGSSTPT GAACAPGDYG
RQALSPAEAE KRSGGKRKSD SSDSQEGNYK SEVNSKPRKE RTAFTKEQIR
ELEAEFAHHN YLTRLRRYEI AVNLDLTERQ VKVWFQNRRM KWKRVKGGQQ
GAAAREKELV NVKKGTLLPS ELSGIGAATL QQTGDSIANE DSHDSDHSSE
HAHL
Кодований геном білок за функціями належить до активаторів , білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Lepage D.F., Walsh K. (1994). Molecular cloning and localization of the human GAX gene to 7p21 . Genomics . 24 : 535—540. PMID 7713505 doi :10.1006/geno.1994.1663
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi :10.1101/gr.2596504
Salichs E., Ledda A., Mularoni L., Alba M.M., de la Luna S. (2009). Genome-wide analysis of histidine repeats reveals their role in the localization of human proteins to the nuclear speckles compartment. PLoS Genet . 5 : E1000397—E1000397. PMID 19266028 doi :10.1371/journal.pgen.1000397
Douville J.M., Cheung D.Y., Herbert K.L., Moffatt T., Wigle J.T. (2011). Mechanisms of MEOX1 and MEOX2 regulation of the cyclin dependent kinase inhibitors p21 and p16 in vascular endothelial cells. PLoS ONE . 6 : E29099—E29099. PMID 22206000 doi :10.1371/journal.pone.0029099
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші